| Eman Eman, öncelikle iletim elektron mikroskopi topluluğuna yönelik bir bilimsel görüntü işleme araçları paketidir. |
Şimdi İndirin |
Eman Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- Steve Ludtke
- yayıncı web sitesi:
- http://blake.bcm.edu/EMAN/
Eman Etiketler
Eman Açıklama
EMAN, öncelikle iletim elektron mikroskopi topluluğuna yönelik bir bilimsel görüntü işleme araçları paketidir. EMAN, öncelikle iletim elektron mikroskopi topluluğuna, diğer alanlarda da kullanılmaya başlamasına yönelik bir bilimsel görüntü işleme araçları paketidir. Tek partikül rekonstrüksiyonu olarak bilinen bir görevi gerçekleştirmeye yönelik belirli bir odak noktasına sahiptir. Bu yöntem, nano ölçekli moleküllerin ve vitröz (camsı) buza gömülü moleküler tertibatların görüntüleri bir şanzıman elektron mikroskobu üzerinde toplanır, ardından EMAN kullanılarak tamamlandı 3 - Artık atomik çözünürlüğe yaklaşırken çözünürlükteki recosntruction. Düşük çözünürlüklü yapılar için (~ 2 nm), bu ~ 8 saatlik bilgisayar işleme ve birkaç bin parçacık gerektirebilir. büyük hesaplamalı kümelerde) gerekli olabilir. Nitekim, Eman, genellikle büyük ölçekli hesaplama için bir test uygulaması olarak süper bilgisayarlarda kullanılır. Bilimsel görüntü işleme, tipik 'Photoshop' görüntü işlemeden doğada analiz edildiğinden ayırt edilir. Eman'da işlenen görüntüler yüzen nokta GreYScale görüntüleridir. Yani, görüntülerdeki piksel değerleri, küçük tamsayılar olarak değil (tipik GIF / JPG / PNG görüntüleri, her piksel için 0-255'ten entegre değerlerle sınırlıdır) .Processing, fourier'de karmaşık görüntü işleme işlemlerini içerir. veya dalgacık alanı. Eman, ilk olarak 1999 yılında piyasaya sürüldü ve o zamandan beri sürekli gelişme altındaydı. Popüler Python komut dosyası diline bağlanan yüzlerce farklı görüntü / hacim işleme algoritmasından oluşan bir C ++ kütüphanesinden oluşur. Yeni Eman Geliştirme'de, (200'den fazla EMAN 1.8'de) tüm kullanıcı düzeyinde programlar Python'da geliştirilmiş, bilgili son kullanıcının C ++ kaynak kodundan herhangi birini indirmek veya derlemek zorunda kalmadan modifikasyonlar yapmasına izin verecek olan Python'da geliştirilmiştir. Bu sürümde: · Refine2d.py'de önemli gelişmeler yapılmıştır. · Tüm yeni veri kümelerinde refine2d.py kullanımı şiddetle önerilmektedir. · Bazı programlar, bazı programlar, EMAN2 argümanlarını, yani "programını --Option = Değer" olarak kullanır. , eski stilden ziyade "Program Seçenek = Değer". · EMAN2 ile uyumlu yeni bir HDF5 formatı var. · "İskelet" gibi yeni hava programları eklendi. · Yeni seçenekler Büyük icosahedral nesnelerde daha iyi. · Ağla ilgili sorunlar hala mevcut olsa da, paralellik altyapısı iyileştirildi. · Makeinitialmodel.py'deki rastgele model üretimi düzeltildi.
Eman İlgili Yazılım