Kimya :: File :: pdb protein veri bankası dosya formatı okuyucu / yazar
Şimdi İndirin

Kimya :: File :: pdb Sıralama ve Özet

Kimya :: File :: pdb Etiketler

okuyucu perl pdb Pdb okuyucu Pdb yazarı Protein Veri Bankası

Kimya :: File :: pdb Açıklama

Protein veri bankası dosya formatı okuyucu / yazar Kimya :: File :: PDB, PDB dosyalarını okuyan ve yazan bir Perl modülüdür. PDB dosyası formatı, özellikle protein veri bankasında depolananlar (http://www.rcsb.org/pdb/) proteinleri tanımlamak için yaygın olarak kullanılır. Bu modülün şu anki sürümü, diğer her şeyi görmezden gelen aşağıdaki kayıt türlerini okur: Atom Hetatm Endmdl Endbis Modülü, 'PDB' formatını kimya ile otomatik olarak kaydeder :: mol, böylece PDB dosyaları tanımlanabilir ve kimya tarafından okunabilir ve okunabilir :: mol- > okuma (). AutoDetection Purpuses için, .pdb'de biten dosyaların veya bir satır eşleştirmesi / ^ (Atom | HETATM) sahip olduğunu varsayar. ve kimyayı kullanın :: mol nesneler biraz bilgi atarak .Synopsis kullanın Kimya :: file :: pdb; # Bir PDB dosyasını okuyun $ $ MACRO_MOL = Kimya :: macromol-> okuma ("myfile.pdb"); # Bir PDB dosyası yazın $ macro_mol-> write ("out.pdb"); # Çok modelli bir dosyadaki tüm modelleri okuyun @mols = Kimya :: Makromol-> Okuma ("Models.pdb"); # Bir seferde bir model okuyun $ Dosya = Kimya :: Macromol-> Dosya ("Models.pdb"); $ Dosya-> Aç; süre ($ mol = $ dosya-> read_mol ($ dosya-> fh)) {# $ mol} gereksinimleri ile bir şeyler yapın: · Perl

Kimya :: File :: pdb İlgili Yazılım