| Merkez proteomik tesisleri boru hattı MS / MS proteomik verilerinin analizi için bir boru hattı |
Şimdi İndirin |
Merkez proteomik tesisleri boru hattı Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- David Trudgian
Merkez proteomik tesisleri boru hattı Etiketler
Merkez proteomik tesisleri boru hattı Açıklama
MS / MS proteomik verilerinin analizi için bir boru hattı Merkez proteomik tesisleri boru hattı (CPFP), akademik proteomik çekirdek tesislerinin ihtiyaçlarını hedef alan MS / MS proteomik verilerinin analizi için bir boru hattıdır. Boru hattı, LC-MS / MS proteomik veri kümelerinin kolay ve sağlam arama, doğrulama ve nicelleme sağlamak için birden fazla arama motoru ve Trans Proteomik Boru Hattı (TPP) Araçları kullanır. CPFP şu anda Mascot (Matrix Science), Tandem ile aranır ve K-skoru) ve OMSSA. Tek bir form, her üç programa, parametre dosyaları oluşturmaya ve modifikasyon şartnamelerinde farklılıkları uzlaştırmak zorunda kalmadan, vb. İşleme, bir gridengin kümesinde işler kullanılarak, boru hattının veri hacmi olarak kolayca ölçeklenmesini sağlar. analiz edilmek artar. ITRAQ ve izotop etiketli bir miktar (Silac / Ağır Dimetil / ICAT), Pipeline.CPFP, Oxford Üniversitesi'nde aktif olarak geliştirildi ve Oxford'un çekirdek tesislerinin ihtiyaçlarını desteklemek için günlük olarak kullanıldı. Burada CDDL lisansı altında açık kaynaklı bir yazılım olarak serbest bırakılır.
Merkez proteomik tesisleri boru hattı İlgili Yazılım