mpiblast MPIBlast, NCBI patlamasının bir MPI tabanlı paralel bir uygulamadır.
Şimdi İndirin

mpiblast Sıralama ve Özet

mpiblast Etiketler

paralel Mpi MPI Uygulaması Ncbi patlaması paralel uygulama mpiblast

mpiblast Açıklama

Mpiblast, NCBI patlamasının MPI tabanlı paralel bir uygulamasıdır. Mpiblast, NCBI patlamasının MPI tabanlı paralel bir uygulamasıdır. Proje, FormatDB ve Blastall'ı, MPI yüklü olan bir bilgisayar kümesine paralel olarak patlama işlerini yürüten sürümlerle değiştiren bir çift programdan oluşur. Geleneksel Blast.First, MPIblast'ı kullanmanın iki ana avantajı vardır. Her düğüm veritabanının segmenti daha küçük olduğundan, genellikle tampon önbelleğinde bulunabilir, disk G / Ç'nin ortadan kaldırılması nedeniyle önemli bir hız sağlayabilir. İkincisi, püskürtme kullanıcılarının, işbirliği iletişim taleplerinin düşük olması nedeniyle verimli, düşük maliyetli Beowulf kümelerinden yararlanmalarını sağlar. . Özel bir küme gerektirmez. Değerler: · MPIBlast, bir MPI uygulamasının kurulmasını gerektirir. İki ücretsiz uygulama şunlardır: · mpich - http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/ · lam / mpi - http://www.lam-mpi.org · En yaygın yapılandırmalarında, MPIBlast da gerektirir Bilgisayarların bazı paylaşılan depolama dizini var. Bu, bir NFS montajı, SAMBA payı, AF'ler veya başka herhangi bir paylaşılan ağ dosya sistemi olabilir. Paylaşılan dizinin konumu ~ / .ncbirc yapılandırma dosyasında belirtilmelidir. · Kaynaktan MPIBlast'ı oluşturmak için, FTP://ftp.ncbi.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/Limitations :· adresinde bulunan NCBI Toolbox'un eşleşen bir sürümünü derlemeniz gerekir. MpiformaTDB tarafından çoğu sistemde, NCBI patlaması ile mpiblast arasındaki e-değerindeki küçük farklılıklar, sonuç işlemedeki sayısal kararsızlık nedeniyle mevcut olabilir. Çoğu sonuç etkilenmez. 1.4.0-pio'da yeni olanlar.

mpiblast İlgili Yazılım