Abaşas Monte edilmiş av tüfeği dizilerinin algoritmik tabanlı otomatik tarama
Şimdi İndirin

Abaşas Sıralama ve Özet

Abaşas Etiketler

görselleştirmek hizalamak primer astar alignemnt Astarı görselleştir bulaştırmak

Abaşas Açıklama

Monte edilmiş av tüfeği dizilerinin algoritmik tabanlı otomatik tarama Abacas, hızla bir referans sekansına dayanan av tüfeği monte edilmiş contig'lerdeki boşlukları kapatmak için hızlı bir şekilde (hizalayın, düzenleyin, yönlendirin), tasarlar ve görselleştirmeyi amaçlar. daha sonra üst üste binen contigs ve hesaplardaki boşluklar alan bir psödomolekül oluşturmak için işlenir. Abacas, Artemis Yasası'ndaki sipariş edilen ve yönlendirilmiş contigs görselleştirmek için kullanılabilecek bir karşılaştırma dosyası oluşturur. Synteny, renk yoğunluğunun karşılaştırılabilir bloklar arasında yüzde kimliğinin daha düşük değerleriyle azaldığı kırmızı çubuklarla temsil edilir. Oryantasyon, yüzde kimlik, kapsama ve diğer contig'lerle örtüşme gibi kongreler hakkındaki bilgiler, çıkış özelliği dosyasını harekete geçirerek de görselleştirilebilir. Gereksinimler: · Mummer · Artemis Yasası (isteğe bağlı) Bu sürümde yenilikler: · Bu, ABACAS'ın en son sürümüdür.

Abaşas İlgili Yazılım