Cazibe Kimyasal Kinetik İçin Stokastik Simülasyonlar
Şimdi İndirin

Cazibe Sıralama ve Özet

Cazibe Etiketler

benzetmek simülatör simülasyon stokastik simülasyon kimyasal simülasyon kimyasal simülatör

Cazibe Açıklama

Kimyasal kinetik için stokastik simülasyonlar Cain, kimyasal reaksiyonların stokastik ve deterministik simülasyonlarını gerçekleştirir. Çok çekirdekli bilgisayarları kullanmak için birden fazla simülasyon işlemini ortaya çıkarabilir. Cain, modelleri, simülasyon parametrelerini ve simülasyon sonuçlarını (popülasyonlar ve reaksiyon sayıları) bir XML formatında saklar. Ek olarak, SBML modelleri ithal edilebilir ve ihraç edilebilir. Modelleri ve simülasyon parametrelerini giriş dosyalarından okuyabilirsiniz veya bunları programın içinden düzenleyebilirsiniz. Aşağıda gösterilen GUI (Grafiksel Kullanıcı Arabirimi) Python'da yazılır ve Wxpython Toolkit'i kullanır. Çözücüler, CAIN tarafından yönlendirilen C ++ ile yazılmış komut satırı çalıştırılabilirleri olarak uygulanır. Bu, toplu işleri başlatmayı kolaylaştırır. Ayrıca, yeni çözücüler ekleme işlemini de kolaylaştırır. Cain çeşitli çözücüler sunar: · Gillespie'nin doğrudan yöntemi. · Gillespie'nin ilk reaksiyon yöntemi. · Gibson ve Bruck'ın bir sonraki reaksiyon yöntemi. · Tau-slayap. · Hibrit doğrudan / tau-sıçrama. · ODE entegrasyonu. Not: Cain, BSD lisansı şartlarına göre lisanslı ve dağıtılır. Gereksinimler: · Python · Wxpython · MATPLOTLIB Bu sürümde yenilikler: · Kullanıcı arayüzünü ve yardım menüsünü geliştirdi. Histogram çıkışının kaydedilmesinde bir hata düzeltildi.

Cazibe İlgili Yazılım