Jeton
Şimdi İndirin

Jeton Sıralama ve Özet

Jeton Etiketler

sıra adapte olmak dizi analizi Kodon Usagre Adapte organizma dizisi Kodon kullanımı

Jeton Açıklama

Kodon kullanımını sterilen prokaryotik organizmalara uyarlar JCAT, kodon kullanımını en sekanslı prokaryotik organizmalara ve seçilen ökaryotik organizmalara uyarlamak için basit bir yöntem sunan ücretsiz bir programdır. Kodon adaptasyonu, yabancı genlerin ev sahiplerine eksprese edildiği ve ev sahibinin kodon kullanımı, genin kaynaklandığı organizmanın içinden farklı olduğu durumlarda önemli bir rol oynar. Ana bilgisayardaki uygun olmayan kodonlar, örneğin küçük bir ifade oranına yol açabilir. Adaptasyon, PM Sharp et.al. tarafından önerilen CAI değerlerine dayanır. CAI-değerler, bir Carbone etinden bir algoritma uygulanarak hesaplandı. al. Fare ve insanın ökaryotik genomları, kromozomlar boyunca farklı önyargılar içerir ve algoritma bu sorun için mükemmel değil. Bu alandaki sonuçlar bakım ile ele alınmalıdır. Belirli bir organizmanın ortalama kodon kullanımı, bu organizmanın tüm genlerinin tüm CAI-değerlerinin (bir amino asit dizisi olmayan genler hariç, örn. Bu veri, kodon adaptasyonunun grafik çıkışında da sunulmaktadır. Gereksinimler: · Java 1.4 veya üstü

Jeton İlgili Yazılım