Kayış Proteinleri sırayla ve 3D yapısına göre hizalayan kullanıcı dostu bir Java programı
Şimdi İndirin

Kayış Sıralama ve Özet

Kayış Etiketler

protein hizalamak Biyoloji Hizala Protein mRNA dizisi protein açıklaması

Kayış Açıklama

Bir kullanıcı dostu bir Java programı bu dizinin ve 3D-yapı ile hizalar proteinler KAYIŞ destekler proteinlerin ve bütünleştirir yüzlerce eşzamanlı analiz asit sekansı, 3D-yapısı ve genomic- ve mRNA sekansı, ikincil yapı amino olduğu bir çapraz platform programı ve tortu, annotation.The hizalama MS-Word dışa ve değiştirilebilir veya diğer metin işlemcileri dahil öğretici bir saat gibi kısa bir sürede STRAP kullanımını öğretecek. scriptability ve extendability yapmak ÇEMBER hatta en gelişmiş kullanıcılar için çok güçlü bir araçtır. İşte "STRAP" bazı temel özellikleri şunlardır: · Dizi hizalamaları hesaplama · Wiki'nin Hesaplama: TM-hizada ya da CE ya da Gangsta + 3D-üst üste: 3D-üste yerleştirilen (Örnek çıkışı) ve yapısı PUBMED proteinlerin birden hizalamalar göre. Kombine dizi-yapı sıralamalarını göstermektedir. · WIKI kullanarak 3D-görselleştirme: pirol veya WIKI: Jmol veya RasMol ve VMD. Hazırlık aşamasında: yasara vurgulama mutasyonlar, WIKI: SNP, WIKI: ekson-intron 3D'de yüksek sıra muhafaza ile sınırları veya bölgeler. 3D nesneler, diziler ve hizalama arasındaki anlık çapraz seçimi · WIKI: Blast "Blast Alert" dahil arama · Tahmin: WIKI: Transmembran heliks, WIKI: İkincil Yapıları ve WIKI: sarılmış bobin · Amino asit dizilerine nükleotid dizilerinin yapıldı. nükleotid diziler amino asit sıralamalarından çıkış. · Protein dosya formatları: WIKI: Swissprot, WIKI: PDB, WIKI: Fasta, MSF, BIOWIKI: Stockholm, WIKI: ClustalW, WIKI: Nexus, HSSP WIKI: Gen Bankası, EMBL Jalview ve GeneBee: ATV, WIKI ile · Filogenetik ağaçlar · Kalıntı ek açıklamalar ve nükleotid açıklamalar Vurgulama WIKI: normal ifadeler (yani PROSITE-Grafikleri) WIKI kullanılarak: Artan arama ve WIKI: dizisi vikiden özellikleri: DAS sunucuları: nedeniyle düşük dizi benzerliğine zor dizi hizalaması Yardın: · Mekansal eşdeğer bakiyelerin vurgulamak için CE ve TM-hizalamak kullanılarak C-alfa atomu, 3D-üst üste · Dotplot · Orta Diziler · Karışık dizi hizalamaları ve protein yapı hizalama · WIKI: Eklentiler, üçüncü taraf geliştiricilerin STRAP için uzantılarıdır. Gereksinimler: · Java · Objective-C ve Fortran derleyicileri

Kayış İlgili Yazılım