Macclade MacClade - Filogenetik analiz için tasarlanmış bir yazılım.
Şimdi İndirin

Macclade Sıralama ve Özet

Macclade Etiketler

analiz diyagram Diyagram Oluştur filogenetik Filogenetik analiz ağaç diyagramı

Macclade Açıklama

MacClade - Filogenetik analiz için tasarlanmış bir yazılım. MacClade, David Maddison ve Wayne Maddison tarafından yazılmış filogenetik analiz için bir bilgisayar programıdır. Analitik gücü, evrimin karakter çalışmalarında. Birçok yeni ekran modu ve düzenleme araçları dahil. Bunlardan bazıları geneldir, ancak çoğunluk moleküler sekans verileriyle kullanım için tasarlanmıştır. Burada bunlardan birkaçını söyleyeceğiz. Veri oynatılıyorsa · Verilerin nasıl görüntülenebileceği için birçok seçenek var. İşte iki örnek. · MacClade'nin renk veri hücrelerini renklendirmesini isteyebilirsiniz, böylece devlet varyasyonu kalıpları daha belirgindir. · Protein kodlayan nükleotid verileri ile MacClade'den amino asit çevirisini göstermesini isteyebilirsiniz. Bu çeviri, nükleotidlerde, örneğin hizalama araçlarını kullanarak (bir sonraki bölüme bakın), gösterilen amino asitlerle ilgili hemen güncellemelere neden olan "canlı", gösterilendeki amino asitlerle ilgili hemen güncellemelere neden olmaktadır. Editörde yalnızca bir araç mevcuttur: Ok. MacClade 4, 17 ToolSconSensus sekansı ile bir alet paletine sahiptir · MacClade 4, Konsensüs sekanslarını hesaplayabilir ve gösterebilir. Hesaplama için birkaç seçenek vardır ve birinin değişken katfantın konsensüs sekanslarını göstermesine izin verir. · Windows'u ve nesnelerin seçilmesini ve manipülasyonunu listeler · MacClade 3'te, karakterleri ve çeşitli özelliklerini listelerde bir karakter durumu penceresi vardır. Bu, bir karakterin ağırlıklarını ve türlerini değiştirebileceğiniz penceredir. MacClade 4'te, karakter listesi penceresi çok gelişti ve şimdi takson, ağaçlar, ağırlık kümeleri, tip kümeleri, dahil etme setleri, karakter kümeleri ve takson setleri için eşdeğer pencereler de var. Bu pencerelerde, bu nesneleri yeniden adlandırabilir, yeniden düzenleyebilir, silebilir ve değiştirebilirsiniz. Paup ile İlişkiler: Paup ve Macclade arasındaki etkileşimleri iyileştirmek için MacClade 4'e eklenen çok sayıda özellik vardır. İşte üç örnek: Nexus Block Yönetimi · PAUP blokları da dahil olmak üzere veri dosyasında bulunan çeşitli Nexus bloklarını manipüle edebilirsiniz. Bu, birinin PAUP'nin dosyayı yürüttüğü zaman işlediği komutları düzenlemendir. Contraint Ağaçları · MacClade'yi, ağacın üstüne kısıtlama ağacı olarak kaydetmesini isteyebilirsiniz. Bunu yaparsanız, dosyayı MacClade'ye kaydedin ve ardından Paup * olarak yeniden çalıştırın, Kısıtlama, Paup'un arama ve filtreleme komutları ile kullanıma sunulacaktır. ) Kendisi, Macclade'nin ağaç penceresindeki ağaç üzerindeki tüm kapakların çürüme dizin değerlerini hesaplamak için gerekli metin komutlarını içeren bir PAUP dosyası oluşturacaktır. Eğer bu dosyayı Paup'ta çalıştırırsanız, PAUP, çürüme endekslerini hesaplamak için tüm ilgili aramaları gerçekleştirir. Zayıflamalar: · Devre dışı bırakıldı Bu sürümde yeni olanlar: Oku] · TAXON LİSTESİ penceresinde belirsizlik veya polimorfizm sayısını gösterme.

Macclade İlgili Yazılım