Molel Mac'iniz için ücretsiz ve açık kaynaklı bir moleküler görselleştirme uygulaması
Şimdi İndirin

Molel Sıralama ve Özet

Molel Etiketler

görselleştirmek görselleştirici molekülü görselleştirmek molekül molekül görselleştirici molekül görselleştirme

Molel Açıklama

Mac'iniz için ücretsiz ve açık kaynaklı bir moleküler görselleştirme uygulaması Molekel, kullanımı kolay ve ücretsiz çok platformlu moleküler görselleştirme programıdır. İşte "Molekel" nin bazı önemli özellikleri: · Farklı dosya formatlarından moleküler verileri okuyun · Farklı stillerle molekülleri göster: uzayFill, top ve çubuk, top ve tel, sopa, omurga (kalıntılar), şerit (artıklar), şematik (kalıntı) · Atom ve Bond boyutunu değiştirin · Dosyadan atom renklerini okuyun · Dipol momentini görüntüleyin (bu bilgiyi içeren moleküler formatlar için) · Bazı dosya formatlarında mevcut olan yörünge ve titreşim bilgilerini kullanarak atomları canlandırın · Çoklu çerçeveli PDB ve XYZ dosyalarından okunan molekülleri canlandırın · Her animasyonlu atomun hızını ve hareketini göstermek için okları görüntüleyin · Moleküler yüzeyleri canlandırın (amimasyon dışa aktarırken) · Mesafe ve (Dihedral) açılı hesaplamalar yapın · Skaler alanları (örneğin elektrostatik potansiyeli) görselleştirmek için bir düzlemsel prob kullanın ve Skaler alanın değerini 3B alanda belirli bir noktada görüntüleyin. · İsteğe bağlı olarak elektrostatik potansiyeli ile renk kodlu olan moleküler orbital ISO yüzeylerini görselleştirin. · İsteğe bağlı olarak elektrostatik potansiyel ile renk kodlu olan yoğunluk matrisinden üretilen yüzeyleri görselleştirin. · Yüzeyleri ızgara verilerinden (Gauss küp formatında veya ADF tape41 dosyalarından okunur) isteğe bağlı olarak elektrostatik potansiyeli ile renk kodludur. · Laplacian pürüzsüzleştirici ile ızgara verilerinden (Gaussian .cube) üretilen pürüzsüz yüzeyler · SAS ve SES yüzeylerine eşlemek için .Cube dosyalarından moleküler elektrostatik potansiyel olarak okunan ızgara verilerini kullanın. · Solvent erişilebilen yüzeyi, isteğe bağlı olarak elektrostatik potansiyeli olan renk kodlu olan ISO-yüzeyi olarak hesaplayın. · İsteğe bağlı olarak M.F. kullanarak çözücü hariç tutulan yüzeyi hesaplayın ve görüntüleme. Shanner'ın MSMS programı (şiddetle tavsiye), buraya getirin · Molekülü bir dizi moleküler dosya formatına verin · POV'a ihracat (deneysel, OpenBabel aracılığıyla) · TIFF, PNG, PostScript ve PDF'ye İhracat · Programlanabilir gölgelendiriciler (GLSL) desteği · Radyasyon spektrumlarının görselleştirilmesi (Kızılötesi ve Raman) · Çok katmanlı saydam yüzeylerin takma önleyici ve doğru işleme ile yüksek kaliteli çok geçiş yapılması · Titreşim modlarının harmanlanması Bu sürümde yenilikler: · Saydam nesnelerin doğru şekilde oluşturulması için derinlik soyulması için destek eklendi; OpenGL 2.0 kartı gerektirir ve bazı sistemlerde düzgün çalışmayabilir. Derinlik Soyma Parametreleri Oluşturma Hızı / Şeffaf Nesnelerin Kalitesini Etkileme, Ekran-> Özellikler iletişim kutusundan ayarlanabilir. · PostScript ve PDF çıkışlı kızılötesi ve Raman spektrumunun arsası eklendi · VTK 5.1 ile entegre (CVS versiyonu, çünkü henüz resmi bir sürüm yok) · Karşılaştırma için destek, varsayılan olarak devre dışı bırakıldı; Ekran-> Özellikler iletişim kutusundaki etkinleştirilebilir. · Şeffaflık ve orbital yüzeylerin renklerini değiştirmek artık mümkün. · Elektron Yoğunluğu Yüzey iletişim kutusunda kalıcı ayarlar için destek eklendi. · VTK 5.1 ile düzgün çalışan yeni X-ışını gölgelendiricileri eklendi. Sabit hatalar: · 392 - Çok moleküllü oyunlar girişi için destek ekleyin · 401 - Connolly yüzeyini silemez · 403 - Komut satırı desteği · 404 - Hata okuma Moleküler Orbital Veri · 405 - Şeffaflık Hem orbital renkler için tutarlı değil (belirli karta / sürücüye bağlı) · 406 - Molekülü sildikten sonra animasyon çalışır · 408 - Özellik İsteği: Sıfırdan Orbital Endeksi Başlat · 420 - Pencereyi kapatırken ayarlar kaydedilmedi · 421 - Izgara Verilerinden Yüzey: Geçen Zaman Raporu Yanlış · 422 - Şeffaf SES ile animasyonları kaydedebilirsiniz

Molel İlgili Yazılım