Üçkâğıtçı köklü üçlülerden fikir birliği ağaçları inşa etmek için bir program
Şimdi İndirin

Üçkâğıtçı Sıralama ve Özet

Üçkâğıtçı Etiketler

sıra dizi jeneratörü kurucu inşa etmek Dosya Kilidi Dosya Hider uzlaşma protein konsensüs dizisi fikir birliği sırası Program oluşturma Azaltılmış Konsensüs Yöntemi fikir birliği ağacı görüntüleyicisi dizi kurucu yapı dizisi üç kat N-üçlüler haberci ucube jar yazılımı Veri Girişi Uygulaması Video Editör Nokia film boyutu kompresörü Nokia 6120 Torch Ücretsiz TV C300 iyi yankılar mac

Üçkâğıtçı Açıklama

Tripleca, köklü üçlülerden uzlaşma ağaçları inşa etmek için bir program olmak için geliştirilmiştir. Kullanımı java -jar triplec.jar noreps infile.newick Burada Noreps, fikir birliği için kullanılacak üçlü rekonstrüksiyon sayısıdır. Bu gereklidir, çünkü rekonstrüksiyon randomize bir algoritmadır. Yaklaşık 20 taksonun küçük ağaçları için 1000 kopya yeterlidir. Ancak daha büyük veri setleri için daha büyük sayılar kullanılmalıdır. İnfile.newick, satır başına bir Newick ağacı olan bir metin dosyasıdır. Ağaçlar köklü olarak kabul edilir ve her ağaç sadece ilk ağacın taksi etiketlerini içermelidir. Bu, ilk önce yeni takson içermemelidir. Konsensüsün bir parçası olarak ilk ağacın daha az taksona sahip ağaçların olması bir hata olmasa da, bu yöntem bir süper ağaç yöntemi değildir. Bu koşullar kapsamındaki performans test edilmedi ve kötü performans göstereceğiz.

Üçkâğıtçı İlgili Yazılım