İstiridye Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- The Regents of the University of California
- İşletim sistemleri:
- Windows All
İstiridye Etiketler
İstiridye Açıklama
İstiridye, metagenomik diziler için size bir dizi kompozisyon tabanlı sınıflandırıcı sunmak için özel olarak tasarlanmış kullanışlı bir uygulamadır. İstiridye, sıralama bileşimine dayanarak her bir sekansın imzalarını yakalayarak çalışır. Her sekans, altta yatan Markov zincir özelliklerine sahip bir de Bruijn grafiğinde bir yürüyüş olarak modellenmiştir. İstiridye, altta yatan Markov zincirinin sabit parametrelerini yanı sıra bu imzayı oluşturmak için temel de Bruijn grafiğinin yapısal parametrelerini yakalar. Uygulamada, her bir sekansın kınama için, böyle bir imza, eğitim kümeleri için hesaplanan benzer imgelerle hesaplanır ve eşleştirilir. Normalleştirilmiş mesafe kesme kazanmasını da nitelendiren en iyi eşleşme kazanır. En iyi eşleşmenin bu kesmeyi nitelendirmemesi durumunda, dizi birikintili olmaya devam eder.
İstiridye İlgili Yazılım