Ağaçlık

filogenetik ağaçları moleküler sekanslardan hesaplar
Şimdi İndirin

Ağaçlık Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Gangolf Jobb
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 1.8 MB

Ağaçlık Etiketler


Ağaçlık Açıklama

Treenfinder uygulaması, filogenetik ağaçları moleküler sekanslardan hesaplar. Program, büyük ağaçları bile çeşitli dizi evrim modellerinde maksimum olasılığa çıkarır. Hem nükleotid hem de amino asit verilerini kabul eder ve heterojenliği dikkate alır. Kullanıcı tanımlı veri bölümleri, ayrı fiyatlar, ayrı kenar uzunlukları, ayrı karakter bileşimleri için ayrı modeller varsayılabilir. Tüm parametreler verilerden tahmin edilebilir. Ağaç arama, kullanıcı tarafından sağlanan topolojik kısıtlamalarla yönlendirilebilir ve ağaçlara başlayabilir. Uygun sekans evrimi modellerini önermek için bir model teklifi vardır. Çıkartılan ağaçların güvenilmesi, parametrik olmayan ve parametrik olmayan önyükleme, çeşitli eşleştirilmiş siteler (ELW, BP, KH, SH, WSH, AU), ayrıca bilgi kriterleri, LR-ELW ile kombinasyon halinde de değerlendirilebilir. Ağaçları ve sıra verilerini manipüle edecek araçlar var, baz frekanslarını görselleştirin, fikir birliği ve mesafe ağaçlarını hesaplar, topolojileri sayar. Tüm sayısal sonuçlar için güven sınırları ve diğer istatistikler elde edilebilir. Program, ayrışma sürelerini hızla yumuşatarak tahmin edebilir. Grafiksel bir kullanıcı arayüzü, Treenfinder'ın kullanımını çok sezgisel hale getirir. Veri dosyaları ve yeniden yapılandırma parametreleri etkileşimli olarak seçilebilir, sonuçlar ekranda görüntülenecektir. Treenfinder, çok çeşitli işlevsellik sunan ve araştırmacının problem belirli uygulamaları oluşturmasını sağlayan fonksiyonel ve sistem bağımsız programlama dili TL'de programlanabilir. Yazılımın parçaları TL olarak yazılmıştır ve kullanıcı tarafından değiştirilebilir. Treadinder'ın Dili TL, biyolojik verileri işlemek için çok sayıda özel alet içeren genel amaçlı bir programlama dilidir. Ağaçak programının bir programlama arayüzü olarak görev yapar. Bu kılavuz, TL'ye genel bir bakış veriyor. Diğer programlama dillerinden farklı olanı yapan şey, çeşitli programlama stillerini desteklemesidir. Herhangi bir zamanda, bir programcı belirli bir durumda en güçlü olan programlama stilini seçebilir.


Ağaçlık İlgili Yazılım

Droplight

Droplight, havuzların dağıtımını sağlar. Dosyaları EXE olarak hazırlar ve dağıtıyor ...

220 1.5 MB

İndirmek