Anc-geni Mesafe bazlı Bayesian yöntemiyle ataların gen dizilerinin çıkarılması
Şimdi İndirin

Anc-geni Sıralama ve Özet

Anc-geni Etiketler

sıra Bayesian çıkarım motoru gen Bulanık çıkarım sistemi nükleotit dizisi çıkarsama sorunu varyasyon yapısı Bayesian Ağ Editörü Bayesian ağını düzenle çıkarım bayes hizalama haplotip çıkarımı Çıkarım aracı Bayesi analisis Bayesian Yöntem Uygulaması Bayesian yöntemi Bayes analizi Mesafe bazlı analiz filojener çıkarım Atalar Geni Kümesi ATESTRAL GENE büyük filogenin çıkarım Bayesian MCMC Analizi Gen dizisi istatiksel sonuç atalar

Anc-geni Açıklama

ANC-Gen uygulama, protein kodlama genlerinin atalarının nükleotit sekanslarının, filogenetik ilişkileri bilinen bir dizi günümüzden bir kümesinden çıkarılması için küçük bir komut satırı aracı olarak geliştirilmiştir. Program ilk önce amino asitleri mesafe tabanlı Bayesian yöntemiyle inceler ve sonra çıkarılan amino asitleri sabitleyerek altta yatan nükleotit sekanslarını inceler. Programı kullanmak için, DNA dizilerini ve bu dizilerin ağaç topolojisini içeren bir giriş dosyasına ihtiyacınız vardır (bir örnek için rnase.seq). Bu dosya iki sayı ile başlar: dizinin sayısı ve dizi başına nükleotid sayısı (sıra uzunluğu). İkinci satır, ilk dizinin adı olacak ve üçüncü satır ilk sıra, vb. Dizilerde sadece A, T, C, G, A, T, C ve G'ye izin verilir. Diziler hizalanmalı ve boşluklar veya diğer semboller kaldırılmalıdır. Dosyanın son satırı, dizilerin ağaç topolojisidir. Ağaç formatı, Phylip Paketinde kullanılan ile aynıdır (Felsenstein 1995). Ağacın sınırlandırıldığını unutmayın, bu nedenle en derin dallanma düğümü için BITICION'tan ziyade hariste gerekir.

Anc-geni İlgili Yazılım