Ata Mesafe bazlı Bayesian yöntemiyle ataların amino asit dizilerinin çıkarılması
Şimdi İndirin

Ata Sıralama ve Özet

Ata Etiketler

sıra Bayesian çıkarım motoru Bulanık çıkarım sistemi amino asit bulmak amino asit bulucu amino asit ara Amino asit analizörü amino asit dizisi amino asit amino asit tercümanı çıkarsama sorunu amino asit özü varyasyon yapısı Bayesian Ağ Editörü Bayesian ağını düzenle çıkarım haplotip çıkarımı Çıkarım aracı filogenetik Bayesi analisis Bayesian Yöntem Uygulaması Bayesian yöntemi amino asit kalıntısı Mesafe bazlı analiz optimal amino asit filojener çıkarım Atalar Geni Kümesi ATESTRAL GENE amino asidi analiz etmek amino asit çiftini analiz et Amino Asitler Çifti Analizi büyük filogenin çıkarım amino asit dizisi analizi amino asit dizisini analiz eder amino asit sınıflandırması Amino Asit Topolojisi Ağaç topolojisi amino-asit dedektörü amino asidi saptamak amino asit zincirini analiz et atalar

Ata Açıklama

Atalar uygulaması, filogenetik ilişkileri bilinen bir dizi homolog amino asit dizisinden atalarının amino asit sekanslarını çıkarmak için tasarlanmıştır. Bu paket bir program içeriyor: C dilinde yazılan ancestor.exe. Programı kullanmak için, amino asit dizilerini ve bu dizilerin ağaç topolojisini içeren bir giriş dosyasına ihtiyacınız vardır (bir örnek için LysozyMe.AA'ya bakınız). Bu dosya iki sayı ile başlar: sekans sayısı ve amino asit alanlarının sayısı (sıra uzunluğu). İkinci satır, ilk dizinin adı olacak ve üçüncü satır ilk sıra, vb. Sıralarda sadece 20 amino asit için tek harf kodu (büyük harf) izin verilir. Diziler hizalanmalı ve boşluklar veya diğer semboller zaten çıkarılmalıdır. Dosyanın son satırı, dizilerin ağaç topolojisidir. Ağaç formatı, Phylip Paketinde kullanılan ile aynıdır (Felsenstein 1995). Ağacın sınırlandırıldığını unutmayın, bu nedenle en derin dallanma düğümü için BITICION'tan ziyade haritacılık gereklidir.

Ata İlgili Yazılım