Bamarray

Mikroarraylar İçin Varyans Analizi
Şimdi İndirin

Bamarray Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Case Western Reserve University
  • İşletim sistemleri:
  • Windows XP / Vista / Vista64 / 7 / 7 x64
  • Dosya boyutu:
  • 9.7 MB

Bamarray Etiketler


Bamarray Açıklama

Bamarray, Bam Tehcnique'yi uygulayan gelişmiş ve profesyonel bir uygulamadır. BAM, mikroarray verilerinden farklı şekilde ifade eden genleri tespit etmek için yeni bir istatistiksel tekniktir. Yöntemin merkezinde, tek başına gerçek sinyal bırakırken yanlış sinyali havalayan özel bir sinyal algılama tekniğidir. Standart Yöntemler Bir seferde bir genden (t-testleri gibi veya ANOVA modellerinden kontrastlar gibi) veri kullanarak temel test istatistiklerine dayanarak genleri arayın. Gen listeleri, genel tip-i hatasını veya yanlış keşif oranını kontrol etmeye çalışarak veya bir kullanıcı tarafından belirtilen kesme seviyesini kullanarak filtreleyerek istatistikleri filtreleme ile elde edilir. BAM, temel olarak farklı bir yaklaşım alır ve bunun yerine, bir genin tüm genlerde aynı anda bilgiyi sentezleyerek farklı etkisini tahmin etmeye odaklanır. Genleri filtrelemek yerine, tahmini etkiler desen tiplerine eşlenir. BAM'in özel sinyal algılama mekanizması, genlerin farklı şekilde ifade edilmesi olası bir şekilde ifade edilmesi muhtemel olmayan ve sonuç olarak ilgi kalıpları, grafiksel görselleştirme araçları kullanılarak oldukça yorumlanabilir hale gelir. İlgi duyulan kalıpları, biyolojik bir sistemi yalnızca belirli bir süre boyunca etkileyen genler veya işlem boyunca yer alan genler olabilir. BAM, bir hastalığın farklı aşamalarında toplanan veriler gibi çok kapalı deneysel tasarımlar için geçerlidir. Diğer uygulamalar arasında, zaman ders verileri, aykırı algılama, değişmez set normalizasyonu, Gene Atlas Transcriptome eşleşmeleri, aynı zamanda diğer birçok problem için gen ekspresyon süresi profilini içerir. Ana Özellikler: Bamarray, farklı işletim sistemlerinde çalışan bir kullanıcı dostu Java uygulamasıdır. Bamarray ayrıca bir komut dosyası dosyası tarafından başlatılan toplu modda katılımsız da çalıştırılabilir. Toplu modu, birkaç veri dosyasını sırayla işleyebilir ve elde edilen analizi diske kaydedebilir. Özel tasarlanmış komut dosyaları yazmak, kullanıcıların bio -onductor ve r gibi farklı yazılım türleriyle arayüzlenmesini sağlar. Bamarray, kullanıcıların daha sonra geri alma için bir koşunun sonuçlarını kaydetmesine izin veren bir kaydetme özelliğine sahiptir. Yürütmek için dakikayacak bir çalışma, geri yükleme çalıştırımını kullanarak sadece birkaç saniye içinde geri yüklenebilir. Kaydet Çalıştır, toplu iş modunda da tetiklenebilir. Sınırsız gruplara sahip deneysel tasarımlar konaklatıldı. Belirli gen desenlerinin tanımlanması için görselleştirme arazileri mevcuttur. Bamarray, genleri otomatik olarak gen desenlerine dönüştürür. Bamarray neredeyse otomatik ve karmaşık ayar parametreleri içermez. Çoğu istatistiksel yöntem, önemli genleri tanımlamak için kullanıcı belirtilen filtreleme değerini gerektirir. Bamarray otomatik bir değer sağlar. genler ve deney grupları arasında eşit olmayan değişkenlikler, genler içindeki grup farklılıklarını (logaritmalar gibi diğer dönüşümlerle) yapay olarak nemlendirmeyen veya büyütmeyen otomatik bir ön işleme aşaması ile sistematik olarak ele alınır. Zoom-in ve Lassoing kullanarak grafiksel araçlar, kullanıcıların etkileşimli olarak gen listelerini oluşturmalarını sağlar. Gen etiketleri, ilgilenilen genlerin kolayca tanımlanmasına izin vererek açılabilir veya kapatılabilir. Özel genler bir açılır liste kullanılarak vurgulanabilir veya mevcut bir dosyada bulunan gen etiketlerinden bir izleme listesi doldurulabilir. Gen listeleri dışa aktarılabilir. Dışa aktarma listeleri, toplu mod modu kullanılarak otomatikleştirilebilir. rakamlar yayın kalitesi renk grafikleri olarak kaydedilebilir. Modelin altta yatan varsayımlarını test etmek için grafiklerin bir parçası olarak yer almaktadır. JRE 6'yı destekler.


Bamarray İlgili Yazılım

Rdp

Fastra dosyalarını bu araçla görüntüleyin ve düzenleyin. ...

407 23.1 MB

İndirmek