| Bissnp BISULFITE-SEQ / Nome SEQ SNPS ve Sitozin Metilasyon Arayan |
Şimdi İndirin |
Bissnp Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- USC Epigenome Center
Bissnp Etiketler
Bissnp Açıklama
BISSNP, genom analizi araç kümesine dayanan faydalı bir araç olarak, özel olarak geliştirilmiştir. Bissnp, genotiplerin ve metilasyon seviyelerini aynı anda belirlemek için farklı sitozin bağlamının manuel olarak belirtilen veya otomatik olarak tahmini metilasyon olasılıkları ile Bayessian çıkarımını kullanır. Yazılım, tek uçlu ve eşleştirilmiş uçlu okumalar için çalışabilir. BISSNP JAVA programlama dilinde geliştirilmiştir. Ana Özellikler: Sağlanan herhangi bir sitozin bağlamının metillenmesini arayın ve özetler (CPG, ChH, CHG, GCH et.al.); Doğru değişken algılama. BSÜLFITE Sıralamasında Temel Kalite Gerilim ve İndel Aramasını Etkinleştir; Çoklu çıkış biçimine izin ver, ayrıntılı VCF dosyaları, CPG haplotip mono-alleliik metilasyon analizi için dosyayı okur; UCSC genom tarayıcısında ve IGV tarayıcısında görselleştirme için basitleştirilmiş bedgraph, peruk ve yatak formatı.
Bissnp İlgili Yazılım