Cmbiew

İletişim haritası görselleştirme kolaylaştırdı.
Şimdi İndirin

Cmbiew Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Max-Planck Institute for Informatics
  • Dosya boyutu:
  • 2.4 MB

Cmbiew Etiketler


Cmbiew Açıklama

CMView, kullanışlı, kullanımı kolay, Java tabanlı, etkileşimli bir kontak harita görselleştirme ve analiz uygulamasıdır. CMView, bir protein yapısındaki amino asit kalıntıları arasındaki temas ağı görselleştirmek ve analiz etmek için bir yazılım aracıdır. Resmi olarak, bu ağ, her kalıntının bir düğüme karşılık geldiği ve iki düğümün bir kenarla bağlandığı bir grafiktir. Üç boyutlu yapıda mekansal olarak kapanırlarsa, iki kalıntı temas halinde olduğu kabul edilir. CMView'da, temas tanımı iki paremetre ile belirtilir: temas türü ve mesafe kesimi. İletişim Türü, kalıntının bir alt kümesini tanımlar. İki artık I ve J daha sonra bu alt kümeden biri olan iki atom, biri ve bir J'DAN BİR ATOM'TA, CUTOFF'tan daha fazla değil. Temas ağının bir matris olarak (resmi olarak, kontak grafiğinin bitişik matrisi) bir kontak haritası olarak adlandırılır. Ana Özellikler: Kombine İletişim Haritası ve 3B Yapı Görünümü (Pyyol Kullanımı) Çeşitli IM ve İhracat Seçenekleri: PDB dosyaları, çevrimiçi pdb, görüntü ihracatı, CASP tahmin formatı ve diğerleri Kullanıcı tanımlı iletişim tanımları ile temas haritalarının hesaplanması özellik bakımından zengin 3D moleküler görselleştirme için pymol ile entegrasyon Yapı ve Dahili Sıra veya Yapısal Hizalamaları Kullanarak Harita Karşılaştırma Mesafe haritası, fark haritası, temas yoğunluğu analizi


Cmbiew İlgili Yazılım

Molpov

Bu araçla Brookhaven protein veri bankası dosyalarını okuyun. ...

228 2.6 MB

İndirmek