Cvit Bu aracın yardımıyla kromozomları görüntüleyin
Şimdi İndirin

Cvit Sıralama ve Özet

Cvit Etiketler

izleyici görüş kromozom genom dizisi

Cvit Açıklama

CVIT, kromozom görüntüleme aracı için kısa, çeşitli haritalarda veya genomik dizilerde özellikleri gösteren PNG görüntüleri üretmek için kullanılabilecek bir Perl uygulaması olarak tasarlanmıştır. Kasıtlı olarak basit ve etkileşimli olmasa, örneğin interaktif web sayfalarının içine CVIT'yi sarmak mümkün olmasına rağmen. Giriş, GFF3 formatındaki bir veya daha fazla veri dosyasından oluşur. Veriler bir veya daha fazla "kromozom" tanımlayan kayıtlar içermelidir (bu bir bağlantı grubunu, psuedomolecule, bac, contig, herhangi bir bitişik DNA dizisi veya hatta bir protein yapısı). Bu "kromozomlar", özelliklerin üzerine yerleştirildiği omurgadır. CVIT, baz çiftleri, centimorganlar (genetik haritalar) ve Centimcclintok'lar (sitogenetik haritalar) dahil olmak üzere herhangi bir bitişik koordinat sistemi görüntüleyecektir. Koordinatlar ileri (en büyüğe en küçük) veya geriye doğru çalışabilir (en büyüğe). Çıktı, kromozomun (lar) ve özelliklerin bir PNG görüntüsünden, bir efsane görüntüsünden ve özellik koordinatlarının bir listesinden oluşur.

Cvit İlgili Yazılım