Cytoseed Metabolik modellerinizi bu aracın yardımıyla yönetin
Şimdi İndirin

Cytoseed Sıralama ve Özet

Cytoseed Etiketler

Eklenti izleyici manipülatör Sitoskape eklentisi

Cytoseed Açıklama

Cytoseed, model tohumunu kullanarak oluşturulan metabolik modelleri görüntülemenize, manipüle etmenize ve analiz etmenize yardımcı olabilecek bir sitoskape eklentisi olarak inşa edilmiştir. Cytoseed eklentisi, model tohumlarının kullanıcılarının, ilgilenilen organizmalar için üretilen reaksiyon ağlarının bilgilendirici görselleştirmelerini oluşturmasını sağlamak için tasarlanmıştır. Kullanıcılar model tohumunda erişebilecekleri herhangi bir model yükleyebilir. Cytoseed eklentisi model verilerini, reaksiyonları ve bileşikleri model tohumundan indirir ve reaksiyonları, karşılık gelen Kegg yolu haritalarına göre ağlara yönelir. İlk yükten sonra (birkaç dakika sürebilir), model verileri, sonraki oturumlarda hızlı yükleme için kullanıcının masaüstünde belirtilen bir klasörde saklanır. Ana Özellikler: Model tohumundan modelleri indirme; Modelleri görüntülemek için sitroskape seanslarının oluşturulması; sitoskape oturumlarını kaydetme ve yeniden açma Yol haritalarının oluşturulması ve silinmesi; yol haritaları arasındaki reaksiyonları taşıma / kopyalama; Yol haritalarında düğümleri gizleme / gösterme Flux değişkenlik analizinin görselleştirilmesi birden fazla ortamda sonuçlanır; Reaksiyonlar, temel / aktif / etkin olmayan / boşluk dolu kategorilere dayanarak renklidir Bir sitososcape oturumunda birden fazla organizma için modelleri açma özelliği, karşılaştırmalı model analizini (/ li] akı denge analizi sonuçlarının görselleştirilmesi

Cytoseed İlgili Yazılım