Dna ejderhası

DNA Sırası Contig Assembler Yazılımı
Şimdi İndirin

Dna ejderhası Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Trial
  • Yayıncı adı:
  • SequentiX
  • Dosya boyutu:
  • 486 KB

Dna ejderhası Etiketler


Dna ejderhası Açıklama

DNA Dragon, sekans formatlarından (Fastra, EMBL, GENBANK, vb.), TRACE dosya formatlarından (SCF, Abi, AB1) ve yeni nesil sıralama dosyası formatlarından (Illumina, SFF, GFF) (Illumina, SFF, GFF )'dan 100000'den fazla numune kullanabilen gelişmiş bir DNA yardımcı programıdır. , vb). Not : Deneme, yazılımdaki "Lisans Düğmesi" kullanılarak çalıştırılabilir. Ana Özellikler: En popüler sekans formatlarını okur: (Fastra, Genbank, EMBL, SCF, ABI, AB1, SSF, Gelecek nesil). Çoklu Kırpma Özellikleri: Vektör, Kalite ve Uzunluk Kırpma. Hızlı montaj makinesi, projeleri 100000'den fazla diziyle gerçekleştirir. Desteklenen dosya formatları: Proje dosyaları: XML DNA DRAGON XML Projesi (* .xml) Sıra Dosyası Formatları: embl (* .eb; *. Ebi; *. EMBL) GenBank (* .gb; *. Gen; *. Genbank; *. txt) Fastra (* .fa; *. Fas; *. Hızlı; *. Fastra; *. FS; *. FSA; *. FSTA) Gelecek nesil sıralama dosya formatları: ABI Katı dosyaları (* .gff) Katı CSFASTA Dosyaları (* .csfastA) Solexa Kompakt ASCII okuma formatı, eşarp (S _ * _ sequence.txt) illumina _seq.txt dosyaları (* .txt) Illumina FastQ dosyaları (* .fastq) Illumina Qseq dosyaları (* _qseq.txt) 454 Standart Flowgram Dosyaları (* .SFF) Hizalama dosya formatları: Sıra Hizalama / Harita (SAM) Biçimi (* .sam) ikili hizalama formatı (* .bam) (* .bam) Trace Dosya Biçimleri: SCF (* .SCF) abi (* .abi; *. AB1) Navigator Ağacı: Örnek bir navigator ağacı, proje yapısını (contig'ler ve örnekler) çok netleştirir. Buradan numuneler seçilir, daha sonra kesilmiş ve monte edilir. Kırpma ve Numaralandırma özellikleri: astar-kırpma otomatik psödokirsekülerleştirme (50 üs) ile vektör kırpma. Herhangi bir önceki bilgi olmadan dizilerdeki varsayımsal vektör motiflerini tespit edebilirsiniz. Sıra Kalite Tabanlı Kırpma Uzunluk Kırpma çözünmeni: Kesme biterlerini geri yükler. montaj makinesi ve contig Editörü: Montaj parametrelerini değiştirmek için çeşitli seçenekler mevcuttur. Contigs içindeki dizilerin otomatik sıralanmasıyla (ofset ve trim uçları) hızlı, endeks tabanlı dizilerin montajı proje yönetimini bir zevk haline getirir. Contig'lerin (sıralama hizalaması), yani temellerin izleri ile karşılaştırılması ve fikir birliği dizilerinin ihracat / kopyası neredeyse kendi kendini açıklayıcıdır.


Dna ejderhası İlgili Yazılım

dft2html

Bu yardımcı programla DFT dosyalarını HTML'ye dönüştürün. ...

200 29 KB

İndirmek

Sadaka

Python'da yazılmış hafif adım tabanlı simülasyon modülü ...

234 30 KB

İndirmek