| Dnadistree DNA dizilerinden uzak mesafeli filogenin çıkarım için bir yazılım. |
Şimdi İndirin |
Dnadistree Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- Christian Michel
- İşletim sistemleri:
- Windows All
Dnadistree Etiketler
Dnadistree Açıklama
Dnadistree, türler arasında doğru topolojik ilişkileri gösteren mesafe bazlı filogenetik ağaçları çıkarmak için tasarlanmıştır. Daha kesin olarak, Dnadistree birkaç ardışık adım gerçekleştirir: 1. DNA dizisi hizalamalarını (nükleotitler veya kodonlar) okur; 2. Her sekans çifti arasında tarafsız çift mesafeleri tahmin eder. Bu amaç için, Dnadistree, hem DNA hem de kodon modellerinin evrimsel modellerine dayanan çok sayıda formül kullanıyor (daha fazla ayrıntı için buraya bakınız); 3. Dört aglomeratif algoritması sayesinde filogenetik ağacı oluşturur; 4. Mesafe matrisleri ve / veya mesafe bazlı ağaçlarla ilgili istatistiksel önlemleri hesaplar. Bununla birlikte, Dnadistree, sağlam dal uzunluklarını tahmin etmek için tasarlanmamıştır; Daha kesin mesafe veya ml bazlı dal uzunluğu tahminleri için Dnadistree tarafından çıkarılan ağaçlar ile fitch (filip paketinde), FastME, Phyml veya PAML kullanmanız önerilir. Dnadistree'ye gerçekten ne yapabileceğini görmeye çalışın!
Dnadistree İlgili Yazılım