Dotplot

nokta arsa analiz aracı
Şimdi İndirin

Dotplot Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Ramin Charles Nakisa
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 90 KB

Dotplot Etiketler


Dotplot Açıklama

Hızlı memnuniyet için, iki nöronal nikotinik asetilkolin reseptörü alt birim dizisini, Swissprot'tan A2 ve A3'e kaydedilen Swissprot'tan karşılaştırmayı deneyin. Arayüz, diğer herhangi bir Windows programı gibidir. Yatay diziyi yüklemek için Dosya Açılır menüsünü kullanın. Geçerli dizindeki tüm dosyaları listeleyen bir iletişim kutusu alın. A2'yi seçin, ardından program, Size daha az önce kullandığınız sırayla bir miktar söyleyen bir SEQINFO iletişim kutusu verir. adı, uzunluğu, sıra formatı ve DNA, RNA veya protein olup olmadığı. Tamam'ı tıklayın. Ardından dikey sekans için tekrarlayın, A3'ü seçer. MSDOS sürümünde olduğu gibi, aşağıda ayrıntılı olarak açıklanan dotplotu hesaplamanın iki yolu vardır. Hızlı bir düzeltme için, Beraberlik Açılır menüsündeki Kimlikler seçeneğini kullanın. Varsayılan parametreler bir pencere boyutu 10 ve 6. bir eşiğdir. Bu, ekranınız boyunca çapraz bir çizgi verir. Dotplotu parametreleri tıklatarak ve eşiği 1. güzel olarak ayarlayarak ayarlamayı deneyin, değil mi? C-terminalindeki proteinin ortasındaki üç transmembran bölgesini ve nihai transmembrani bile görebilirsiniz. Bir insan epidermal büyüme faktörü resepteki iç tekrarları bulmaya çalışın. Bunu yapmak için, EGFR olarak adlandırılan diziyi hem yatay hem de dikey sekans olarak yükleyin. Ardından parametreleri pencere = 20 ve eşik = 1 olarak ayarlayın. PAM250.mat'ı "Açık Matrix'i Aç" seçeneğini kullanarak PAM250.mat skor matrisini yükleyin. Dotplot uygulaması nokta arsa analiz aracı olacak şekilde geliştirilmiştir.


Dotplot İlgili Yazılım

Rdp

Fastra dosyalarını bu araçla görüntüleyin ve düzenleyin. ...

407 23.1 MB

İndirmek