FilonetBu uygulama ile retiküle evrimsel ilişkileri analiz edin. | |
Şimdi İndirin |
Filonet Sıralama ve Özet
Reklamcılık
- Lisans:
- GPL
- Yayıncı adı:
- Department of Computer Science Rice University
- İşletim sistemleri:
- Windows All
- Dosya boyutu:
- 1.4 MB
Filonet Etiketler
- analiz Aktar Analiz etmek ilişki kurmak evrimsel süreç Evrimsel algoritma Evrimsel algoritma oluşturun evrimsel algoritmayı geliştirmek evrimsel ağaç Evrimsel algoritmayı belirtin evrimsel Evrimsel Araştırma Sistemi Evrimsel hesaplama Evrimsel Clade Evrimsel Simülasyon gen transferi Filogenetik Ağı Mağaza Evrimsel Genetiği Simüle Evrimsel İzleme Yöntemi Evrimsel Desen Analizi Evrimsel Biyoloji Aracı Evrimsel Veri Görüntüleyicisi Evrimsel verileri analiz edin Wsdl ilişkileri ilişkiler Keyman Amharca Yazılımı aplikasi düzenlemek www.nokia n72 software.com wifi şifre kraker çin mobil bilgisayar ücretsiz indir oyunu LG GD350 PC www.soft Freez Sürücü Sökücü Hava Durumu Docklet Vista ekran kaydedici altın ücretsiz antivirüs kurulumu
Filonet Açıklama
Filonet, kullanıcılara retiküle (treelicik olmayan) evrimsel ilişkileri yeniden oluşturmak ve analiz etmek için bir araç paketi sunmak için özel olarak tasarlanmış kullanışlı, kullanımı kolay bir araçtır. Özellikle, yazılım paketi, bir çift türden / gen ağaçından yatay gen transferini çıkarmak ve bir dizi hizalamada arası rekombinasyon kesme noktalarını tespit etmek için özellikleri içerir. Ayrıca, filogenetik ağları okuma / saklama ve filogenetik ağların topolojilerini karşılaştırma yeteneklerine sahiptir. Filogenetik ağ rekonstrüksiyonu ve değerlendirmesi için algoritmalar olarak, filogenetik ağaçların alanından algoritmik teknikleri kullanırken, paket ayrıca, maksimum anlaşma alt üstlerini, Robinson-Foulds mesafe önlemleri vb. Hesaplama modülleri gibi çeşitli ağaçlara yönelik özellikler içerir. Ana Özellikler: Direk - Maksimum Anlaşma Alttree RF - Robinson-Foulds / Simetrik Fark Ağaç Ölçümü Riatahgt - HGT olaylarını bir çift türden / gen ağaçlarından tespit etmek için heuristics LCA - Bir ağaçtaki bir dizi düğümün en az ortak atası RECOP - Aralıklı rekombinasyon kesme noktalarını tespit etmek için pencere tabanlı bir yöntem Charnet - Bir ağda kümeleri, ağaçları ve tripartmalarını hesaplamak için bir araç CMPNETS - İki ağ arasındaki mesafeyi hesaplamak için bir araç Netpars - Filogenetik Ağların Parsimonosyonunu Puanlandırma Aracı Kontoal - Bir genin bir tür ağacının dalları içindeki tüm geçerli birleşme senaryolarını numaralandırmak için bir araç GENCPECT - Bir tür ağaçları için CPLEX ile çözülebilecek bir MILP formülasyonu oluşturmak için bir araç ve bir set gen ağaçları Genst - Maksimum uyumlu küme kümelerine dayanan tür ağaç topolotileri üretmek için bir araçtır. Compute_st (Bu araç bir Perl betiğidir) - türleri koalesanın altındaki gen ağaçlarından yeniden yapılandırmak için. infer_st - tür ağacını gen ağaçlarından çıkarmak için. İçerdiği yöntemler, MDC, MDC, zaman, cam, genişletilmiş çoğunluk uzmanı ve demokratik oy içerir. Deep_coal__Count - Ekstra soyların sayısını saymak için sim_gtinnetwork - Yu ve ark. Syst Biol 2010 Kağıt
Filonet İlgili Yazılım