Fpg

Sabit büyüklükteki bir nüfusu simüle eder
Şimdi İndirin

Fpg Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Jody Hey
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 65 KB

Fpg Etiketler


Fpg Açıklama

FPG adı ileri popülasyon genetik simülasyonu anlamına gelir. FPG, mutasyon, rekombinasyon, doğal seleksiyon ve göç de dahil olmak üzere çeşitli evrimsel işlemler geçiren sabit bir boyut nüfusunu simüle eder. Bu bağlamda "ileri" anlamı, sadece bu zamandır, simülasyon dahilinde, gerçek dünyada olduğu gibi ileri doğru hareket eder. Bu, birleşme nüfusu genetik simülasyonunun, simülasyon içinde temsil edildiği gibi, geçmişe geri döner. Birleşme simülasyonlarının birçok avantajı vardır, ancak birden fazla sitede doğal seçimi içeriyorlarsa hantallardır. FPG, doğal seçimin genetik değişim kalıpları üzerindeki etkisini değerlendirmek için kullanışlıdır. Gerçek dünya durumlarını oldukça büyük nüfus büyüklükleri ve uzun DNA uzatması boyunca yüksek mutasyon oranları ile yaklaşık olarak yaklaşık olarak elde edebilecek şekilde tasarlanmıştır. Mutasyon modeli, sonsuz bir yer modelidir, yani nüfusa ayrışan bir site başka bir mutasyon alabilir. Simülasyon, katkı maddesi, çarpıcı ve epistatik fitness modelleri de dahil olmak üzere çeşitli fitness modelleri altında nötr, faydalı ve zararlı mutasyonları barındırır. Program, polimorfizm düzeyleri, heterozigotite (gözlemlenen ve beklenen), sabitleme oranları ve bağlantı dengelemesi dahil olmak üzere çok çeşitli analizler oluşturur. Döndürüldüğünde göç, nüfus yapısına ilişkin birkaç analiz yapılır .. Temel yaşam döngüsü haploid genomları (gametler) ve diploid genomları (zigotlar) arasında değişmektedir ve aşağıdaki gibi gelirler: - Gametler rastgele zigotlara eşleştirilir - Fitness, taşıytığı mutasyonların bir fonksiyonu olarak her zigot için ölçülür. Baskınlık 0,5 olarak ayarlanırsa, model bir haploid seçim modeline en çok açılandırır. - Üreme başarısı, gelecek nesline katkıda bulunan gamet sayısıdır ve her fitness sınıfının göreceli fitness değerleri olan beklentilerle multinomal bir dağılımdan çekilerek her zigot için belirlenir. - Gamet üretimi sırasında rekombinasyon ve mutasyon meydana gelir. - Birden fazla popülasyon varsa, gametler her popülasyondan rastgele çizilir ve rastgele diğer popülasyonlara yerleştirilir. Göçmenler tarafından yer değiştiren bu gametler kaybolur, bu nedenle göç, bir genetik sürüklenme ekstra bir unsuru ekler. Bu bir ada-göç modelidir - Yeni zigotes, rastgele gamet birliği tarafından oluşturulur. Nesiller örtüşmeyen.


Fpg İlgili Yazılım

dft2html

Bu yardımcı programla DFT dosyalarını HTML'ye dönüştürün. ...

200 29 KB

İndirmek

Sadaka

Python'da yazılmış hafif adım tabanlı simülasyon modülü ...

234 30 KB

İndirmek