GEDI-ADMX

Karıştırılmış popülasyonlar için genotip hata tespiti ve itici
Şimdi İndirin

GEDI-ADMX Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Bioinformatics Lab
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 7.3 MB

GEDI-ADMX Etiketler


GEDI-ADMX Açıklama

GEDI-ADMX, cinselleştirilmemiş bireylerden genotip verilerini ele almak için yapılmış bir uygulamadır. Yerel ata çıkarıp, her olası yerel ata altında yazılan tüm SNP lokasyonlarında genotipleri itaat etmek için atalarda Hoplotypes'te eğitilmiş bir faktörör HMM'ler kullanır. GEDI-ADMX, her oduya, ilgi odağında ortalanmış birden fazla SNP pencerelerine dayanan, birden fazla SNP pencerelerine dayanan ağırlıklı oylama şeması kullanılarak değerlendirilen yerel soyları veren yerel soyları atar. Yazılan SNP'lerde eksik genotiplerin hata algılaması ve emilmesi kullanılarak gerçekleştirilir. Multilocus genotip olasılıkları, çıkarılan yerel atalara karşılık gelen Faktör Hmm'e dayanarak hesaplandı. Her çözülmemiş SNP'deki genotiplerin emilmesi, benzer bir faktörör HMM yayılarak K (varsayılan K = 10), emsalsiz yerlerden önce ve sonra yazılan benzer bir faktörör HMM ile hesaplanan posterior genotip olasılıklarına dayanarak gerçekleştirilir. GEDI-ADMX paketi şunları yönetmektedir: · Yerel soyundan çıkarım · SNP genotip hatası algılama ve düzeltme · Yazılan SNP'lerde eksik genotiplerin emilmesi ve · Yılandırılmış SNP'lerde genotiplerin emilmesi.


GEDI-ADMX İlgili Yazılım

Hakkımızda