Ga bulanık kümeleme

mikroarray verileri için bir kümeleme aracı
Şimdi İndirin

Ga bulanık kümeleme Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • BioRainbow Group
  • Dosya boyutu:
  • 444 KB

Ga bulanık kümeleme Etiketler


Ga bulanık kümeleme Açıklama

GA bulanık kümeleme uygulaması, mikroarray verilerinin ve mesafe matrisi verilerinin kümelenmesi için genetik algoritma ve C-araçları yönteminin kombinasyonunu kullanan bir program olarak geliştirilmiştir. Giriş dosya formatı :: - Bu program giriş olarak düz bir metin dosyası kullanır. - Tüm veri öğeleri tabulatörlerle ayrılmalıdır. - Kayıp değerlere izin verilmez. Mikroarray: - İlk satır tüm sütunların adlarını içerir. - Her satır (ikinci ile başlayarak), her koşul için gen adına (1 sütun veya daha fazla) ve ifade değerlerine sahip olmalıdır. Mesafe matrisi: - İlk satır başlık içerir (tek kelime veya 1. konumda bir dize) ve öğelerin isimleri - Her satır (İkincisiyle başlar), elementin adını (karşılık gelen sütundaki gibi) ve bu eleman ile diğerleri arasındaki mesafelerin değerlerini içermelidir. - Matris simetriktir. - Tüm değerler normalleştirilir (1.0'dan büyük değil). - Not: Benzerlik matrisi de izin verilir. Çıkış dosya formatı: - Algoritmanın parametreleri - Kümelerindeki genlerin dağılımı (eğer üyelik> 1 / nuberofclusters ise) - Tüm genler için üyelik matrisi - Kümeler merkezlerinin koordinatları (gen ekspresyon birimlerinde)


Ga bulanık kümeleme İlgili Yazılım