| Ga bulanık kümeleme mikroarray verileri için bir kümeleme aracı |
Şimdi İndirin |
Ga bulanık kümeleme Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- BioRainbow Group
Ga bulanık kümeleme Etiketler
Ga bulanık kümeleme Açıklama
GA bulanık kümeleme uygulaması, mikroarray verilerinin ve mesafe matrisi verilerinin kümelenmesi için genetik algoritma ve C-araçları yönteminin kombinasyonunu kullanan bir program olarak geliştirilmiştir. Giriş dosya formatı :: - Bu program giriş olarak düz bir metin dosyası kullanır. - Tüm veri öğeleri tabulatörlerle ayrılmalıdır. - Kayıp değerlere izin verilmez. Mikroarray: - İlk satır tüm sütunların adlarını içerir. - Her satır (ikinci ile başlayarak), her koşul için gen adına (1 sütun veya daha fazla) ve ifade değerlerine sahip olmalıdır. Mesafe matrisi: - İlk satır başlık içerir (tek kelime veya 1. konumda bir dize) ve öğelerin isimleri - Her satır (İkincisiyle başlar), elementin adını (karşılık gelen sütundaki gibi) ve bu eleman ile diğerleri arasındaki mesafelerin değerlerini içermelidir. - Matris simetriktir. - Tüm değerler normalleştirilir (1.0'dan büyük değil). - Not: Benzerlik matrisi de izin verilir. Çıkış dosya formatı: - Algoritmanın parametreleri - Kümelerindeki genlerin dağılımı (eğer üyelik> 1 / nuberofclusters ise) - Tüm genler için üyelik matrisi - Kümeler merkezlerinin koordinatları (gen ekspresyon birimlerinde)
Ga bulanık kümeleme İlgili Yazılım