Gz gama

Her amino asit sitesindeki beklenen ikame sayısının tahmini
Şimdi İndirin

Gz gama Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Jianzhi Zhang
  • Dosya boyutu:
  • 133 KB

Gz gama Etiketler


Gz gama Açıklama

GZ-GAMMA, her bir amino asit (nükleotit) bölgesinin beklenen ikame sayısını ve gama şeklindeki parametreyi, sitogenetik ilişkilerinin filogenetik ilişkilerinin bir kombinasyonu kullanılarak, siteler arasındaki oran değişimi için tahmin etmek için geliştirilmiştir. Homolog diziler bilinmektedir. Bu paket iki program içerir: amino asit dizileri için GZ-AA.exe ve C dilinde kodlanmış DNA dizileri için GZ-DNA.EXE. Programı kullanmak için, amino asit (veya nükleotit) dizilerini ve bu dizilerin ağaç topolojisini içeren bir giriş dosyasına ihtiyacınız vardır (bir örnek için ATP6.AA'ya bakınız). Bu dosya iki sayı ile başlar: sekans sayısı ve amino asit veya nükleotit alanlarının sayısı (sıra uzunluğu). İkinci satır, ilk dizinin adı olacak ve üçüncü satır ilk sıra, vb. Her sekans kesintisiz bir çizgi kaplamalıdır. Dizilerde sadece 20 amino asit (veya 4 nükleotid) için yalnızca harflere izin verilir. Boşluklar veya diğer semboller zaten kaldırılmış olmalıdır. Dosyanın son satırı, dizilerin ağaç topolojisidir. Ağaç formatı, Phylip paketinde kullanılan ile aynıdır. Ağacın sınırlandırıldığını unutmayın, bu nedenle en derin dallanma düğümü için BITICION'tan ziyade haritacılık gereklidir.


Gz gama İlgili Yazılım

dft2html

Bu yardımcı programla DFT dosyalarını HTML'ye dönüştürün. ...

200 29 KB

İndirmek

Sadaka

Python'da yazılmış hafif adım tabanlı simülasyon modülü ...

234 30 KB

İndirmek