Haploview haplotip analizi kolaylaştı.
Şimdi İndirin

Haploview Sıralama ve Özet

Haploview Etiketler

analiz Analiz etmek Ölçek haplotip tahmini Happotip tahmin ortak haplotip happotip çizmek boya haplotipi happotip haplotip ağacı haplotip çıkarımı Haplotip tarif et haplotipe dizisi haplotip analizi haplotip blok analizi haplotip ilişkilendirme testi haplotip derneği haplotip verileri Y-kromozomal haplotip

Haploview Açıklama

Haplotip analizi, benzerlikleri paylaşan DNA segmentlerini tanımlamak için moleküler genetik testler için tasarlanmıştır. Haploview, bu tür bir analiz ile ilgili görevleri geliştirmek için oluşturulmuştur. Uygulama, Platform'u artıran ve bir kurulum işleminden geçmeye gerek yoktur ve bir kurulum işleminden geçmeye gerek yoktur. İstisele Edilen dosya formatları ve seçenekleri, en fazla beş dosyanın yüklenmesini kabul eden tek bir panel ile basittir. Formatlar: Standart bağlantı, HAPMAP projesinden veri dökümü, faz veya plink. Ayrıca "-batch" komut satırını uygulayarak birden fazla dosyayı yükleme desteği de vardır. Uygulamaya yüklenen seçilen dosya biçiminden bağımsız olarak aynı parametreler özelleştirilebilir. Bunlar, belirlenen bir değerin üzerinde olabilen işaretçilerin çift karşılaştırmasına karşılık gelir (varsayılan 500KB olarak ayarlanmıştır). İkinci bir parametre, bireylerde eksik genotiplerin miktarını ifade eder. Kullanıcı ayar değerine bağlı olarak, bu bireyler analizden hariç tutulabilir. Desteklenen dosya formatlarından bazıları için ek yapılandırma ayarları mevcuttur. Standart bağlantı durumunda, kullanıcılar dernek testini, aile üçlüsünü verilerin veya bir test dosyası yükleme imkanı vardır. Böyle bir dosyayı yükledikten sonra, LD Plot, Haplotypes, Kontrol İşaretleyicileri veya Tagger'ı içeren çeşitli ekranlar vardır (çift işletme yaklaşımlarının potansiyel verimliliği ile ikili yöntemleri birleştirir). Faz formatı ile, İnternet bağlantısı varsa HAPMAP Bilgi Parçası indirilebilir. İşlevsellik Program, LD ve Haplotip analizini çalıştırmak için de kullanılabilir ve popülasyondaki happotip frekansını tahmin edin. İşlevlerin listesi, dernek önemini ortaya çıkarabilecek permütasyon testini de destekler. SONUSISHAPLOVIEW, haplotip analizi işlemiyle ilgili birkaç görevi destekleyen bilimsel uygulamalara sahip bir programdır. Konuyu aşina olan öğrenciler tarafından kullanılabilir ve işlevsellik ve kullanılabilirlik açısından da esnektir. Bu yorum Ionut Ilascu tarafından yapılmıştır, Son Güncelleme 7 Mart 2014

Haploview İlgili Yazılım