Ho hon Muhafazakar ve radikal bıkkın mesafeleri hesaplamak için bir yöntem
Şimdi İndirin

Ho hon Sıralama ve Özet

Ho hon Etiketler

sıra DNA dizisi DNA radikal bozulma radikal etki radikal mesafe amino asit mesafe izleyici nonnonymous oranı Patiistik Mesafeleri Bul isimsiz mesafe amino asit sınıflandırması radikal saçmalık mesafe Saçmalık değiştirme radikal öğrenci mesafeleri dönüştür haritalama mesafeleri

Ho hon Açıklama

Hon-yeni uygulama, protein kodlama DNA dizileri arasındaki muhafazakar ve radikal samitedeki mesafeleri tahmin etmek için tasarlanmıştır. Yöntem, geçiş yanlılığını dikkate alarak Hughes, OTA ve Nei'nin (1990) orijinal yönteminden değiştirilir. Üç tip amino asit sınıflandırması (şarj, polarite ve Miyata ve Yasunaga) sağlanır. Biri, konservatif ve radikal amino asit değişikliklerini de tanımlayabilir. Biri amino asit gruplarını tanımlayabilir, böylece gruplar arasındaki değişiklikler radikaldir ve gruplar içinde muhafazakardır. Bunu yapmak için, self.div adlı bir dosyayı oluşturun. Bu dosyada, ilk satır amino asit grupları olmalıdır (örneğin, şarj olması durumunda, üç grup vardır), ikinci satır, birinci gruptaki amino asit sayısıdır, bir boşluk ve gruptaki amino asitler. Tek harfli amino asit kodu kullanılmalıdır. Sonraki satır ikinci grup için bilgi olacaktır. Birincisi, toplamda N grupları varsa, ilk N-1 gruplarının bilgisini girmesi gerekir, çünkü son grup, ilk N-1 gruplarının bilgilerinden elde edilebilir.

Ho hon İlgili Yazılım