Küme x

Bu uygulama, DNA veya proteinler için genel amaçlı birden fazla sekans hizalama programına sahiptir.
Şimdi İndirin

Küme x Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • The European Bioinformatics Institute
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 4.7 MB

Küme x Etiketler


Küme x Açıklama

Clustal X, proteinler ve DNA için birden fazla sekans hizalaması ile ilgilenen gelişmiş bir programdır. Clustalw için bir GUI olarak tasarlanan program, derinlemesine dizilim analizini gerçekleştirirken, aynı zamanda uygun karşılaştırmalar yapmak için birçok yardımcı program sunarken. Swissprot, NBRF / PIR, Pearson (FASTA), GCG / MSF (PERTUP), Klustal (* .aln), GCG9 / RSF ve GDE. İçe aktarma işlemi sırasında Clustal X, dizilerin nükleotitleri veya amino asitlerin olup olmadığını tespit etmeye çalışır, ancak seçimin doğru olacağı gerçek bir garanti yoktur. Akıllıca vurgulama Önemli unsurları kaynak dosyası yüklendi, sıra hizalaması programın ana penceresinde gösterilecektir. Yerleşik renklendirme şeması, korunmuş özellikleri vurgulamayı, canlı renklerle dışarı çıkmalarını sağlar. Dizilerin içeriğini ayırt etmek için, daha büyük bir yazı tipi kullanmanız önerilir; Bu, yakınlaştırılmış bir dizi görüntüsüne neden olur, kompozisyonunu tespit etmeyi kolaylaştırır. Programın izin verilen kolay hizalama processthe operasyonları listeyi oluşturur; Mevcut bir hizaya, bir parçayı kesip yapıştırmak, bir dizge aramak veya mevcut boşlukları kaldırmak için bir diziyi ekleyebilirsiniz. Ayrıca, aşağıdaki yöntemlerden biriyle hizalamalar yapabilirsiniz: tamamlayın (sırayla tam bir analiz geçirir), yalnızca rehber ağacı veya seçilen dizilerin ve / veya kalıntı aralıklarının yeniden düzenlenmesi. Bir hizalama işlemine başlamadan önce, sonuçların kesinleşmesi için tüm parametreleri (yeni boşluklar, protein boşlukları) sıfırlamanız önerilir. Verileri analiz edin ve analizin en önemli göstergelerinin bir hizalama kalitesi slowone alın, her sütun için tek tek için çizilen hizalama kalitesi puanı olacaktır. Yüksek bir puan, iyi korunmuş bir sütunu belirlerken, düşük koruma seviyeleri daha düşük bir puanla gösterilir. Sonuç olarak, analiz, yapılması gereken bilimsel amacına uygun olarak ayarlanması gereken çeşitli parametrelere bağlıdır. Kesinlikle, program bilim adamları için mükemmel bir seçimdir ve ayrıca DNA diziliminden bir taşıyıcı yapmak isteyen öğrenciler. Bu yorum 14 Temmuz 2014 tarihinde yapılan en güncel AndreeA Matei tarafından yapılmıştır.


Küme x İlgili Yazılım

BsasiDewalk3d

Tebeşir veya diğer medya kullanarak anamorfik 3D yanılsamalarını kaldırımlara veya diğer yüzeylere aktarın. ...

591 1.91MB

İndirmek