Linux için Hızlı İstatistiksel Hizalama FSA, olasılıksal birden fazla sekans hizalama algoritmasıdır.
Şimdi İndirin

Linux için Hızlı İstatistiksel Hizalama Sıralama ve Özet

Linux için Hızlı İstatistiksel Hizalama Etiketler

Linux için Hızlı İstatistiksel Hizalama Açıklama

Reklamcılık Linux için hızlı istatistiksel hizalama, Robert Bradley tarafından geliştirilen bir ev ve eğitim yazılımıdır. Deneme ve testimizden sonra, yazılımın resmi, güvenli ve ücretsiz olduğu kanıtlanmıştır. İşte Linux için hızlı istatistiksel hizalama için resmi açıklama: FSA, homolog protein, RNA veya DNA dizilerini hizalamak için "mesafe bazlı" bir yaklaşım kullanan olasılıklı bir çoklu sekans hizalama algoritmasıdır. Komşu-birleştirme gibi mesafe bazlı filogenetik rekonstrüksiyon yöntemleri gibi, yalnızca çift bir ayrışma tahminlerini kullanarak bir filojen haline getirin, FSA, yalnızca eşleşim homolojisi tahminlerini kullanarak birden fazla hizalama oluşturur. Bu, ikili karşılaştırmalardan birden fazla hizalama oluşturmak için dizi tavlama tekniği tarafından mümkün hale getirilir. FSA, daha önce sadece küçük ölçekli proteinlerin veya RNA'ların küçük ölçekli analizleri için, binlerce diziyi veya megabase-uzun dizileri hizalamak gibi büyük ölçekli problemlere sunar. FSA, daha iyi hizalamalar inşa etmek için birkaç yeni yöntem sunar: FSA, her bir giriş dizisi seti için anında boşluk ve ikame parametrelerini tahmin etmek için makine-öğrenme tekniklerini kullanır. Bu "sorguya özel öğrenme" hizalama yöntemi, FSA'yı çok sağlamlaştırır: çok farklı evrimsel kısıtlamalara tabi olan homolog dizilerin setlerinin üstün hizalamaları üretebilir. FSA, birden fazla hizalamanın hesaplamalı maliyetini azaltmak için randomize bir çıkarım algoritması kullanarak yüzlerce veya hatta binlerce diziyi hizalayabilir. Bu randomize çıkarım, az miktarda doğruluk kaybına sahip doğrudan bir yaklaşımdan on kat daha hızlı olabilir. FSA, çapaları çözmek için "çapa tavlama" tekniğini kullanarak çok uzun dizileri hızlı bir şekilde hizalayabilir ve bunları geçişli çapa ile yansıtıyor. Daha sonra yukarıda açıklanan yöntemleri kullanarak çapalar arasındaki hizalamayı bir araya getirir. Dahil edilen GUI, MAD (çoklu hizalama ekranı), FSA tarafından üretilen ara hizalamaları, her karakterin doğru şekilde hizalandığı olasılığa göre renklendirileceği

Linux için Hızlı İstatistiksel Hizalama İlgili Yazılım