Mcalign

İndel Evrim'in açık modellerine dayanan kodsuz DNA dizilerinin hizalanması
Şimdi İndirin

Mcalign Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Peter Keightley
  • Dosya boyutu:
  • 87 KB

Mcalign Etiketler


Mcalign Açıklama

Kodsuz olmayan DNA'nın güvenilir bir şekilde hizalanması, bilinmeyen ekleme / silme (indel) olayları nedeniyle zordur. Nükleotit farklılıklarının sayısı (kırmızı olarak gösterilmiştir), alternatif hizalamalar arasında kökten radikal bir şekilde farklılık gösterir, ancak başka bir bilgi olmadan, bu ne kadar makul olduğunun söylenmesi imkansızdır. McAliign, bu sorunu açık bir indel evrimi modelini kullanarak sekansları hizalayarak ve bir çift sekans için en muhtemel hizalamayı veya üç dizilişi bilen filogenetik ilişkinin en muhtemel hizalamasını bulur. İndel Evolution modeli iki parametreye sahiptir: (1) Theta, nükleotit ikame frekansına göre frekans inds; (2) W, farklı uzunluktaki indelin göreceli frekanslarının bir vektörü. Bazı taksonlar için modeller sağlanır veya kullanıcı tarafından yeni bir model kurulabilir. McAliign, iki veya üç diziyi hizalabilen bir Monte Carlo tabanlı bir programdır. McALIgn olsun ve yeteneklerini tam olarak değerlendirmeye çalışın!


Mcalign İlgili Yazılım

Hakkımızda