Mcrate

Bu aracın yardımıyla göreceli evrimsel oranını hesaplayın.
Şimdi İndirin

Mcrate Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Itay Mayrose
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 411 KB

Mcrate Etiketler


Mcrate Açıklama

Bir amino-asit bölgesinin değişebileceği derece, yapısal ve fonksiyonel önemine şiddetle bağlıdır. Proteinin aktif bölgesinde olan gibi önemli bir rol oynayan bir amino asit, evrimsel zamanın üzerinde değişmesi muhtemel değildir. Bu nedenle, bir amino-asit bölgesindeki evrimsel oran, bu sitenin ne kadar koruntunun olduğu ve sırayla, bu sitenin proteinin yapısını veya işlevini sürdürmede önemini değerlendirmenizi sağlar. MCRATE, probabilce bazlı bir evrimsel model kullanılarak her bir sitedeki göreceli evrimsel hızı hesaplamak için özel olarak tasarlanmış kullanışlı, kullanımı kolay bir araçtır. Bu, protein ailelerinde altta yatan stokastik işlemin göz önünde bulundurulmasını sağlar. En önemlisi, McRate, tüm olası ağaçların boşluğuna entegre etmek için Markov Zinciri Monte Carlo (MCMC) metodolojisini kullanır. Bu nedenle, McRate, dizilerin ilişkili olduğu önceden mevcut olan bir filogenetik ağacın üstlenmemesidir. McRate, yalnızca tek bir ağaca güvenen Na? Ve yöntemleri üzerinde üstün olduğu bulundu.


Mcrate İlgili Yazılım