| Metasim Sentetik üretin, bu uygulama ile koleksiyonları okur. |
Şimdi İndirin |
Metasim Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- Daniel H. Huson
Metasim Etiketler
Metasim Açıklama
Metasim, tipik metagenome veri kümelerinin çeşitli taksonomik bileşimini yansıtan sentetik okunur koleksiyonları oluşturmanıza yardımcı olmak için özel olarak tasarlanmış faydalı bir araçtır. Verilen genomların bir veritabanına dayanarak, program kullanıcının NCBI taksonomisinin farklı seviyelerinde bulunan genom sayısını belirterek bir metagenome tasarlamasına ve daha sonra bir dizi farklı sekans teknolojisinin simülasyonu kullanılarak metagenome'den okunması için bir metagenome tasarlamasına izin verir. . Bir nüfus örnekleyici isteğe bağlı olarak kaynak genomlarına ve belirli bir evrim ağacına dayanan gelişmiş diziler üretir. Elde edilen veri setleri, sıralama projeleri planlamak için standartlaştırılmış test senaryoları veya kıyaslama montajcı ve metagenomik yazılım olarak kullanılabilir. Ana Özellikler: Kaynak genom sekansları için bir veritabanını entegre eder uyarlanabilir sekanslama hata modellerine göre (örneğin, Sanger Kimyası, Roche's 454 ve Illumina (eski Solexa) (eski Solexa) dayanan sentetik okumalar veya eş çiftleri oluşturur. Kullanıcının, her organizmanın bolluğu değerlerini belirli taksi bileşimlerini modellemek için yapılandırmasını sağlar , kaynak genomlarına ve belirli bir evrim ağacına dayanan gelişmiş sekanslar üretmek için bir nüfus örnekleyici sunar grafiksel kullanıcı arayüzü veya komut satırı modunda kontrol edilebilir
Metasim İlgili Yazılım