Modeltest en uygun nükleotit ikame modelini seçmek için bir araç
Şimdi İndirin

Modeltest Sıralama ve Özet

Modeltest Etiketler

URL değişikliği seçim Metin değiştirme ikame nükleotit oranı Trichview Değiştirme Değiştirme şifresi Shift-sübstition CIPHERS nükleotit dizisi Nükleotit Sırası Yöneticisi nükleotit kısmi ikame Sürücü değiştirme monoalphabetik ikame Nükleotid Değiştirme Modeli nükleotit motifi karmaşık ikame modeli nükleotid ikamesi Model Seçim Çerçevesi hiyerarşik olasılığı Nükleotid Açıklama DNA Değiştirme Modeli Nükleotit hizalamaları Değiştirme DNA Modeli Eşanlamlı ikame Saçmalık değiştirme değiştirme modeli Nükleotit polimorfizmaları nükleotit mutasyonu nükleotid fraksiyonu

Modeltest Açıklama

ModelTest, sonuçları üretmek için Hiyerarşik Hipotez Modelleri arasındaki farkları belirlemek için genetik mühendislerine hizmet vermek için geliştirilen gelişmiş ve güvenilir bir yazılım parçasıdır. komut satırı arayüzü Uygulama oldukça karmaşıktır, çünkü genetiğin yanı sıra, özellikle komut satırı arayüzü aracılığıyla çalışan bir GUI ile çalışan bir GUI ile çalıştırılmamasından bu yana, bu tür bir GUI ile çalıştırılmaması gereken deneyimli kullanıcılar için gereklidir. acemiler için. Bununla birlikte, modeltest kurulum gerektirmez, bu nedenle kullanıcıların yürütülebilir dosyayı yalnızca bir komut isteminin açık örneğine bırakması ve bu da enter tuşuna basın, bu da mevcut komutların kısa bir açıklamasıyla birlikte programın işlevlerini açıklayacak olan ENTER tuşuna basın. İşlevler ve Koşu Parametreleri ModelTest, istenilen modeller için parametre tahminleri ile birlikte, gerekli olan genetik bilgilerini içeren PAUP * tarafından üretilen dosyalarla birlikte çalışması amaçlanmıştır. Karşı ucunda, yardımcı program, yapılan olasılık oranı testlerinin bir açıklamasını ve bunların karşılık gelen p-değerleri, daha sonra yorumlanan ve uygun bir model atanan bilgilerini oluşturur. Desteklenen modeller, JC (JUKES ve Cantor), TRNEF (Tamura-Nei, Eşit Baz Frekanslı TAMURA-NEI), TIM (Geçiş Modeli), GTR (Genel Saat Tersi), F81 (Felsenstein) ve birkaç daha fazla dahil komut satırı arayüzünde listelenmiştir. . Aynı zamanda, kullanıcılar, bunları anlamalarını ve istihdam etmelerini sağlamak için ana pencerede örneklenen belirli bir işlev kümesiyle çalışabilirler. Bu nedenle, kullanıcılar hata ayıklama seviyesini (-D), alfa seviyesini (-A), takson sayısını (-T) belirleyebilir, LRT hesap makinesi modunu (-L) etkinleştirebilir, ortalama (-W) için güven aralığını belirler. veya gelecekteki tüm operasyonlar için AIC yerine BIC'yi kullanın (-B). Uygun ikame modelini belirlemek için kapsamlı bir araç Sonuç olarak, ModernTest, Genetik alanında çalışan profesyoneller için geliştirilen, DNA ikame modellerini karşılaştırmanın yollarını sunan profesyoneller için geliştirilen verimli bir uygulamadır, böylece kullanıcıların verilerine en iyi şekilde uyduğuna karar vermelerine yardımcı olur.

Modeltest İlgili Yazılım