Navigatör Protein-Protein Etkileşim Ağları Görselleştirme Yazılımı.
Şimdi İndirin

Navigatör Sıralama ve Özet

Navigatör Etiketler

analizör analiz görüş

Navigatör Açıklama

Navigator, protein protein etkileşimi ağlarını görselleştirmenize ve analiz etmenize yardımcı olmak için özel olarak tasarlanmış kullanımı kolay, kullanımı kolaydır. Navigator, OPHID / i2D - Çevrimiçi Etkileşim Verileri Veritabanlarını sorgulayabilir - ve 2B veya 3D'deki ağları görüntüler. Ölçeklenebilirlik ve performansı arttırmak için, Navigator, birden fazla donanım platformunda 2D / 3B görselleştirme sistemi sağlamak için Java'yı OpenGL ile birleştirir. Bu araç aynı zamanda analitik özellikler sağlar ve GO ve Proteomics Standartları Girişimi (PSI) gibi standart içe aktarma ve ihracat formatlarını destekler. Ana Özellikler: Navigator, OpenGL'de uygulanan bir görselleştirme sistemini, Java'da uygulanan grafiksel bir kullanıcı arayüzü ve analitik algoritmalarla birleştirir. ağlar bir dosyadan (Sekmeyle sınırlandırılmış, Navigator XML, BioPax veya PSI formatları) yüklenebilir veya OPHID / i2D'ye (interolog etkileşim veritabanı - bilinen bir çevrimiçi veritabanı) bir görsel sorgu çalıştırılarak dinamik olarak oluşturulabilir. HTP ve insan, sıçan, fare, sinek, solucan ve maya) veya Cath için öngörülen protein-protein etkileşimleri. Navigator çalışma alanı, düğümleri ve kenarları keserek, kopyalanarak ve yapıştırılarak manipüle edilebilecek birden fazla ağ panelini destekler. ağlar sekmeyle sınırlandırılmış, navigator XML, PSI veya Pajek formatlarında ve birden fazla grafik formatında (BMP, JPG, TIFF, SVG, PDF) dışa aktarılabilir. ağlar 2D ve 3D'de görüntülenebilir. düğümleri, otomatik kuvvet yönlendirmeli düzen ve manuel yerleştirme karışımı kullanılarak konumlandırılabilir. Kullanılan otomatik düzen algoritmalarından biri, çok düzeyli bir kuvvet yönettiği yerleşim algoritmasıdır (Akıllı Yerleşim ile Grafik Çizimi) . Neredeyse doğrusal zaman karmaşıklığı nedeniyle, Navigator, tam etkileşimleri I2D'den görselleştirebilir. yüksek oranda birbirine bağlı olan alt ağlar ve hub'taki düğümler (yani diğer birçok düğümle etkileşime giren), yardım analizinde otomatik olarak tanımlanabilir. Düğüm grupları, manuel olarak veya otomatik bir şekilde kompozit düğümlere daraltılabilir. Bir ağın alt kümeleri, sendika, kavşak ve fark gibi standart ayar işlemleri kullanılarak yer imi ve manipüle edilebilir. Düğümlerin ve kenarların opaklığı, ağdaki öğelerin kontrastını değiştirmek ve seçilen öğeleri vurgulamak için ayarlanabilir.

Navigatör İlgili Yazılım