Ng-yeni Eş anlamlı ve nonnonymous mesafeleri hesaplamak için modifiye bir Nei-gojobori yöntemi
Şimdi İndirin

Ng-yeni Sıralama ve Özet

Ng-yeni Etiketler

sıra DNA dizisi DNA nükleotit nonnonymous oranı Patiistik Mesafeleri Bul eşanlamlı mesafe isimsiz mesafe radikal saçmalık mesafe Eşanlamlı ikame Saçmalık değiştirme Değiştirilmiş rasyonel yöntem eşanlamlı

Ng-yeni Açıklama

NG-New uygulaması, protein kodlama DNA dizileri arasındaki eşanlamlı ve nonnonous mesafelerini tahmin etmek için küçük bir komut satırı aracı geliştirildi. Yöntem, geçiş yanlılığını dikkate almak için orijinal Nei ve Gojobori (1986) yönteminden değiştirilir. Programı kullanmak için, protein kodlama DNA dizilerini içeren bir giriş dosyasına ihtiyacınız vardır (bir örnek için rnase.seq). Bu dosya iki sayı ile başlar: dizinin sayısı ve dizi başına nükleotid sayısı (sıra uzunluğu). İkinci satır, ilk dizinin adı olacak ve üçüncü satır ilk sıra, vb. Sadece a, g, c, t, a, g, c ve t izin verilir. Boşluklar kaldırılmalı ve diziler önceden hizalanmalıdır. Diziler, yalnızca protein kodlama bölgelerini içermelidir, durdurma kodonları çıkarılır.

Ng-yeni İlgili Yazılım