Pgdspider Nüfus Genetiği ve Genomik Programlarını Bağlamak İçin Veri Dönüştürme Uygulaması
Şimdi İndirin

Pgdspider Sıralama ve Özet

Pgdspider Etiketler

Genetik şifre nüfus genetik popülasyon genetiği

Pgdspider Açıklama

PGDSpider, Java Programlama Dili kullanılarak nüfus genetiği ve genomik programları için bir dönüşüm uygulaması olarak oluşturuldu. Yazılım, çok çeşitli veri türleri için programlar arasındaki veri alışverişi olanaklarını (örneğin, DNA, RNA, NGS, Mikrocatellite, SNP, RFLP, AFLP, çoklu alelli veriler, alel frekansı veya genetik mesafeler) kolaylaştırır. Konvansiyonel popülasyon genetiği formatlarının yanı sıra, PGDSpider, yeni nesil sıralama (NGS) verilerini saklamak ve işlemek için kullanılan nüfus genomik veri formatlarını entegre eder. Halen, PGDSPIDER, çok büyük NGS dosyalarını belleğe yüklerken, boyutu mevcut RAM'i geçebilecek tüm giriş dosyasını belleğe dönüştürmek içindir. Bununla birlikte, PGDSpider, bu NGS dosyalarının belirli alt kümelerini başka bir formata dönüştürmesini sağladığından, belirli bölgeler için parametreleri veya istatistikleri hesaplamak için bu özelliği kullanabilir ve böylece büyük genomik bölgeler üzerinde sürgülü pencere analizini gerçekleştirebilir.

Pgdspider İlgili Yazılım