Proteotipik peptidleri değerlendirmek için SVM tekniği

STEPP, değerlendiren bir proteotipik peptid araçlarıdır.
Şimdi İndirin

Proteotipik peptidleri değerlendirmek için SVM tekniği Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Others
  • Yayıncı adı:
  • Pacific Northwest National Laboratory
  • yayıncı web sitesi:
  • İşletim sistemleri:
  • Windows XP/2000/98
  • Dosya boyutu:
  • 711KB

Proteotipik peptidleri değerlendirmek için SVM tekniği Etiketler


Proteotipik peptidleri değerlendirmek için SVM tekniği Açıklama

Adımlı yazılımı, bir peptidin LC-MS tarafından nasıl olduğunu temsil eden bir puanı oluşturan bir skoru hesaplayabilen eğitimli bir SVM'nin (Destek Vektör Makinesi) uygulanmasını içerir. Program bir protein dosyasını okuyabilir, siliko bir sindirim uygulayabilir ve her triptik veya kısmen triptik peptid için gözlenim puanını hesaplayabilir. Daha büyük (pozitif) puanların bir peptidin daha düşük (negatif) skorların, peptidin proteotipik olduğu tahmin edilmediğinden daha fazla proteotipik olduğu tahmin edildiğini unutmayın. Adımcı tarafından kullanılan SVM modeli, 35 amino asit içeriğinin, şarj, hidrofilikliğin ve proteotipik peptitlerin kantitatif tahmini için polaritenin 35 özelliklerine dayanan basit bir tanımlayıcı alanıdır. Model, bağımsız olarak türetilmiş AMT veritabanıyla (Shewanella Oneidensis, Salmonella Typhimurium, Yersinia Pestis) eğitildi ve doğrulandı. SVM, 0.025'ten az bir standart sapma ile ortalama 0.8 olan ortalama doğruluk ölçüsü ile sonuçlandı.


Proteotipik peptidleri değerlendirmek için SVM tekniği İlgili Yazılım

Mutasyon cd rom

Stok fotoğraf ve dokuların toplanması herhangi bir araç setinin önemli bir parçasını oluşturur. ...

11 734KB

İndirmek

Mükemmel 2D Web Animasyon Paketi Lite

Program, web sayfanız için yüksek kaliteli görüntüler, metinler ve reklamlar oluşturur. Grafikleri düzenlemenizi, metinlerle manipüle etmenize ve gölgeler, floşlar gibi dijital efektleri uygulamanıza yardımcı olan uygun bir arayüze sahiptir. ...

45 4.69MB

İndirmek

Top kapsül

Bu, kullanıcıların etkileşimlerinin gerçekçi simülasyonlarını görünmelerine yardımcı olmak için tasarlanmış bir uygulamadır ... ...

61 4.26MB

İndirmek