| Protest En uygun protein evrim modellerinin seçimi. |
Şimdi İndirin |
Protest Sıralama ve Özet
- Yayıncı adı:
- The University of Vigo
- İşletim sistemleri:
- Windows All
Protest Etiketler
Protest Açıklama
Prottest (ModelTest'in akrabası), belirli bir sekans setine (hizalama) en uygun olan protein evrimi modelini seçmek için bir programdır. Dahil edilen modeller, amino asit değiştirme ve spesifik iyileştirmelerin nispi oranlarını gösteren ampirik ikame matrisleri (WAG, LG, MTREV, DAYHOFF, DCMUT, JTT, VT, BLOSUM62, CPREV, RTRET, MTT, VT, BLOSUM62, CPREV, RTREV, MTM, MTTAr, HIVB ve HIVW) (+ I: Değişmez Siteler, + G: Siteler arasında heterojenite, + F: amino asit frekanslarını gözlemledi) protein yapısının ve fonksiyonun korunmasıyla imkansız olan evrimsel kısıtlamaları hesaba katar. Prottest, AKAIKE bilgi kriterini (AIC) ve diğer istatistikleri (AICC ve BIC), hangi aday modellerden hangisinin eldeki verilere en uygun olduğunu bulmak için kullanır. Protest A yeteneğini tam olarak değerlendirmeye çalışın!
Protest İlgili Yazılım