SEQ-GEN

nükleotit veya amino asit dizilerinin evrimini simüle eder
Şimdi İndirin

SEQ-GEN Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Andrew Rambaut
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 281 KB

SEQ-GEN Etiketler


SEQ-GEN Açıklama

SEQ-GEN, ikame işleminin ortak modellerini kullanarak bir filojen boyunca nükleotid veya amino asit dizilerinin evrimini simüle edecek bir program olarak geliştirilmiştir. Genel ters çevrilebilir model de dahil olmak üzere bir dizi moleküler evrim modeli uygulanmaktadır. Modelin durum frekansları ve diğer parametreleri verilebilir ve sahaya özgü oran heterojenliği de çeşitli şekillerde de dahil edilebilir. Herhangi bir sayıda ağaç okunabilir ve program her ağaç için herhangi bir sayıda veri seti üretecektir. Böylece, büyük çoğaltma simülasyonları kümeleri kolayca oluşturulabilir. Moleküler sekans evriminin yaygın olarak kullanılan (ve hesaplamalı olarak izlenebilir) modellerinin çoğunu içeren genel amaçlı bir simülatör olarak tasarlanmıştır. SEQ-Gen, ANSI C'de yazılmış bir komut satırı kontrollü programdır. Herhangi bir UNIX sisteminde veya iş istasyonunda kolayca derlenmeli ve çalıştırılmalıdır. Bu makale, bir UNIX makinesindeki SEQ-GEN'in kullanımını açıklar. Uygulama, her bir benzetilmiş sekans veri kümesinin boyutuyla orantılı bir miktarda bellek gerektirir. SEQ-Gen çalıştıran SEQ-Gen'i çalıştırmak için yazın: SEQ-gen <[a


SEQ-GEN İlgili Yazılım

dft2html

Bu yardımcı programla DFT dosyalarını HTML'ye dönüştürün. ...

200 29 KB

İndirmek

Sadaka

Python'da yazılmış hafif adım tabanlı simülasyon modülü ...

234 30 KB

İndirmek