Simlipid Öncü ve ürün iyonları verilerini kullanarak lipidleri karakterize etmek için kapsamlı bir bilişim aracı ...
Şimdi İndirin

Simlipid Sıralama ve Özet

Simlipid Etiketler

tanımlayıcı yapısal Analiz bilişim

Simlipid Açıklama

Bir lipit tanımlama yazılımı olan SimliPID, Lipid MS, MS / MS ve MSE verilerini lipit yapısal açıklama ve izotopik örtüşme için deneysel tepe yoğunluğunun düzeltilmesi için analiz eder. Program, metnin, MS Excel, MZData, MZXML ve Waters yerel dosya formatında (MSE), MS Excel, MZDATA, MZXML ve Waters'teki Kütle Spektrometresi ile Elde Edilen Deneysel MS, MS / MS ve MSE verilerini (m / z ve yoğunluk değerleri) kabul eder. Yazılım, SimliPID veritabanında bulunan bilinen lipit yapılarına karşı öncüller arayarak lipid tanımlama ve profil oluşturur. Kolay referans için lipit kimliği, lipit kısaltması, sistematik isim, kompozisyon ve diğer veritabanı bağlantıları gibi ek bilgiler de kullanılabilir. Ne hakkında olduğunu görmek için bir test sürüşü için SimliPID alın! Ana Özellikler: Sağlam lipit yapısı veritabanı: SimliPID veritabanı, 8 lipit kategorileri VIZ içeren büyük bir ilişkisel veritabanıdır. Gliserofosfolipidler, sfingolipidler, yağlı asiller, gliserolipidler, steroller, prenoller, sakarolipidler ve 21905 lipit türüne sahip polikacıklar. Diğer veritabanı bağlantıları arasında Kyoto ansiklopedisi, genler ve genomların (KEGG), insan metabolom veritabanı (HMDB), kimyasal biyolojik ilgi (CEBI), pubchem madde veritabanı, Lipidbank ve Lipidat'ı içerir. Veritabanı sürekli olarak güncellenmektedir. Viz kategorilerinden lipitlerin teorik parçaları. Gliserofosfolipitler, gliserolipidler, prenol lipitleri ve sakarolipidler, teorik kitleleri ve karşılık gelen fragman yapılarıyla birlikte kullanılabilir. Proje Yönetimi: SimliPID, lipit analiz sonuçlarını giriş profilleri ve arama parametreleriyle ilişkilendiren kapsamlı bir proje yönetimi sağlar. Herhangi bir sayıda proje oluşturabilirsiniz. Projeler bir kaynak, laboratuar veya araştırma hedefi temelinde sınıflandırılabilir. MS Lipid Arama: SimliPID, sfingolipidler, yağlı asiller, gliserolipitler, steroller, prenoller, sakarolipitler, poliketitler ve gliserofosfolipitler için SimliPID veritabanında bulunan bilinen lipit yapılarına karşı lipit öncüsü iyonunu arayarak lipit profilini sağlar. Kullanıcılar, 20 ppm veya 2000 Millidalton'a (MDA) daha az veya ona eşit bir hata toleransı olan yüksek çözünürlüklü veriler için MS lipid aramasını yapabilir. SimliPID, pozitif iyon modunda , , , , iyonlarını ve , , destekler + CL], , ve negatif iyon modunda. SimliPID, bu kadar lipit veri analizini kolaylıkla gerçekleştirmek için sezgisel bir kullanıcı arayüzü sunar. MS / MS ve MSE verilerini kullanarak lipit yapısal aydınlatma: SimliPID, Gliserofosfolipitler, gliserolipidler, prenol lipitler ve sakarolipitler için MS / MS ve MSE verilerini kullanarak lipidlerin yapısal açıklamasını destekler. Tanımlanan lipitler, deneysel verilerle teorik lipitlerin yakınlığını belirten yenilikçi bir sıralama algoritmasına dayanmaktadır. Yüksek çözünürlüklü Hata Toleransı ile Hata Toleransı ile Milyonda 1-20 parça (PPM) ve 0.1 ila 2000 Millidalton (MDA) analiz edilebilir. Tanımlanan lipitlerin iki boyutlu yapıları da görüntülenir. Yüksek çıkışlı izotopik en yüksek Lipid MS verilerinin düzeltilmesi: Bir profilin izotop düzeltmesi, lipidlerin biyolojik karışımlardan elde edilen doğru miktarda miktarını kolaylaştırmak için zorunlu adımlardan biridir. SimliPID, izotop yüzdelerini hesaplamak için yüksek verimli bir modül sağlar ve izotopik örtüşmeler için gözlenen deneysel tepe yoğunluklarını düzeltin. Düzeltilmiş yoğunluk değerleri, elektronik tablo uyumlu .csv ve .xls dosya formatlarında dışa aktarılabilir. Kütle Spektrumları Tanımlanan Lipidler ile açıklama SimliPID, MS, MS / MS ve MSE verileri için tanımlanan lipitler ile kitle spektrumlarını açıklayabilir. Bu, teorik lipid yapılarının ürün veritabanından eşleşen deneysel m / z değerlerini vurgulayarak kütle spektrumlarının yorumlanmasına yardımcı olur. Daha iyi lipid karakterizasyonu için, her eşleşen pik, lipit fragmanı adı veya karşılık gelen lipit kimyasal formülü ile açıklanabilir. Açıklamalı kitle spektrumları, bir sayfaya sığacak şekilde veya ilgi alanına dayanarak tekrarlanabilir / yeniden boyutlandırılabilir. Bir kullanıcı, fare imlecini kullanarak veya m / z aralığını belirleyerek belirli bir arsa konumuna giriş / çıkış yapabilir. Ayrıca, kullanıcılar, açıklamalı spektrumları, araştırma grupları arasında bilgi paylaşımını kolaylaştırarak, MS PowerPoint'te yer alabilen görüntüler (PNG ve JPEG formatlarında) olarak dışa aktarabilirler. Rapor Oluştur: Kullanıcı, elektronik tablo uyumlu formatında .csv dosyasında, Lab Dizüstü Bilgisayar, Yayın veya Meslektaşları ile bilgi paylaşımı için yapılan veri analizinin .xls veya .html dosyasında kapsamlı bir rapor oluşturabilir. Her modül için, sezgisel bir arayüz, bir kullanıcının raporda dahil edilecek bilgileri özelleştirmesini sağlar. Bu, MDA, PPM veya DA, yoğunluk değeri, iyon modu, lipit kısaltması, lipid kimliği ve lipidin moleküler yapısını, izotopik yüzdesini ve / veya açıklamalı kütle spektrumlarını hesapladıktan sonra düzeltilmiş yoğunluk değeri içerebilir. Veritabanı Arama: Ayrıca lipit kısaltması / ortak ad, kütle, kimyasal bileşim veya lipit kimliği ile ilgilenilen bir lipit yapısını da arayabilirsiniz.

Simlipid İlgili Yazılım