Snpsift CLI'DAN VCF dosyalarını kolayca manipüle edin
Şimdi İndirin

Snpsift Sıralama ve Özet

Snpsift Etiketler

manipülatör manipule etmek manipülasyon

Snpsift Açıklama

SNPSFT, değişken arama biçimini (VCF) dosyalarının manipüle etmenize yardımcı olabilecek basit ve erişilebilir bir araç koleksiyonudur. SNPSFT JAVA programlama dili kullanılarak tasarlandı ve mevcut tüm büyük işletim sistemlerinde çalıştırılabilir. Ana Özellikler: Filtre: Keyfi ifadeleri kullanarak filtreleyebilirsiniz, örneğin "(REME> 30) | (Indel var) | (Dizinin> 2)". Gerçek ifadeler oldukça karmaşık olabilir, bu yüzden çok fazla esneklik sağlar. Açıklık: Başka bir veritabanından 'kimlik' ekleyebilirsiniz (örneğin DBSNP varyantları) Casecontrol: Kaç tane varyantın 'durumda' ve 'kontrol' gruplarında olduğunu karşılaştırabilirsiniz. Ayrıca, P-Değerlerini (Balıkçı Kesin Testi) hesaplar. TSTV: Transitonu transversiyon oranına hesaplayın. Aralıklar: Aralıklarla kesişen varyantları filtreleyin. RMREFGEN: Referans genotipini çıkarın (yani '0/0' genotiplerini '.')

Snpsift İlgili Yazılım