UEA küçük rna tezgahı Gelecek nesil sıralama cihazlarından küçük RNA verilerini analiz etmek için araçlar paketi
Şimdi İndirin

UEA küçük rna tezgahı Sıralama ve Özet

UEA küçük rna tezgahı Etiketler

UEA küçük rna tezgahı Açıklama

UEA küçük RNA tezgahı, biyologların bitki ve hayvanlardan tek veya çoklu örnek SRNA verilerini analiz etmelerine yardımcı olmak için geliştirilen bir uygulamadır. Bu uygulamayı, ilginç yer işaretlerini (roman mikro RNA dizilerinin tespiti gibi) veya genetik verilerdeki küçük RNA ekspresyon desenlerini profil oluşturma gibi diğer görevleri tanımlamak için kullanabilirsiniz. Ana Özellikler: Adaptör Sökücü: Adaptör parçalarını ham kısa okuma sırası verilerinden kaldırır ve fastra formatına veri çıkarır. Filtre: Sıra uzunluğu, bolluk, karmaşıklık, transfer ve ribozomal RNA çıkarılması da dahil olmak üzere birkaç kullanıcı tanımlı kriter tarafından kontrol edilen bir SRNA veri kümesinin filtrelenmiş bir versiyonunu üretir. Mircat (Mirna Sınıflandırması): Olgun Mirnas'ı ve öncüllerini bir SRNA veri setinden ve bir genomundan tahmin eder. Siloco (Kısa Değiştirme RNA Locuus karşılaştırması): SRNA'ları genomik konuma dayanarak SRNA'ları gruplandırarak birden fazla örnekte SRNA ekspresyon seviyelerini karşılaştırır. TA-SIRNA (Trans-Oyunculuk Kısa Değiştirme RNA): Bitki SRNA veri setlerinde aşamalı ta-sirnas tahmini. MIRPROF (MIRNA PROFİLER): MIRBASE'de bilinen mi Mirnas eşleşen SRNA'ların normalleştirilmiş ekspresyon seviyelerini belirler. Hairpin Açıklama: RNA dizisinden ikincil bir yapı oluşturur ve RNAPLOT kullanarak ilgi bölgelerini vurgular. VISSR (SRNA'ların görselleştirilmesi): SRNA'ların ve kullanıcı ithal eden genomik özelliklerin görsel bir gösterimi oluşturun. Paresnip: Bengradom ile kanıtlanan MIRNA hedeflerini tanımlayın

UEA küçük rna tezgahı İlgili Yazılım