Voroprot Protein yapısının geometrik özelliklerinin analizi için bir araç
Şimdi İndirin

Voroprot Sıralama ve Özet

Voroprot Etiketler

yapı Geometri geometrik protein Geometrik sentezleyici analist geometrik Geometrik Analiz Geometrik modelleme aracı Geometrik ekran koruyucu Protein yapısını görüntüleyin Protein yapısını görüntüleyin protein analizi yapı analizi Geometrik Multigrid Kütüphanesi protein yapısı Geometrik protein özellikleri Protein Veri Bankası Analizi Protein kodlayan gen analizi Protein yapısını keşfedin Protein Dizileri Analizi Protein Aileleri Analizi Beyin Yapısı Analizi Periyodik Yapı Analizi Veri Yapısı Analizi Protein 3D Yapısı

Voroprot Açıklama

Üç boyutlu (3B) protein yapısının geometrik özelliklerini analiz etme ve görselleştirme yeteneği, protein katlama, kalıntı ambalaj, yerleştirme, protein-protein etkileşimlerinin vb. Çalışmaları için temeldir. Gelişmiş geometrik veri yapılarının bazıları böyle bir performans göstermesini sağlar kapsamlı bir şekilde bir analiz. Bu amaç göz önünde bulundurarak, protein yapısının geometrik özelliklerinin analizi için etkileşimli bir araç olan voroprot geliştirdik. Özellikle, diğer benzer yazılım paketlerine dahil edilmeyen geometrik yöntemlerden bazılarını sağlamaya karar verdik. Voroprot, Apollonius diyagramını (ayrıca Voronoi Kürsü Diyagramı olarak da bilinir) ve Apollonius Grafiği (ayrıca Delaunay Kürslerinin Delaunay Triangülasyonu olarak da bilinir), her bir atomun 3B van der Waals yarıçapının bir 3B küresi olmasını düşünün. Voroprot, protein atomu temas yüzeylerini ve solvent erişilebilir yüzeyleri Apollonius diyagramından türetir ve görselleştirmelerine izin verir. Ek olarak, protein yapısının içindeki boşlukları bulabilir ve görüntüleyebilir. Voroprot'ta Apollonius Diyagramını Yapmak için, yalnızca protein atomları için değil, aynı zamanda 3B'de herhangi bir nokta veya küre için de uygulanabilen kendi algoritma uygulamamızı kullandık. Voroprot'a yeteneklerini tam olarak değerlendirmeye çalışın!

Voroprot İlgili Yazılım