 | WhBir spesifikasyon modelinin uyuşmasını yürüten bir bilgisayar programı |
| Şimdi İndirin | |
Wh Sıralama ve Özet
Reklamcılık
Wh Etiketler
Wh Açıklama
WH bir bir türleşme modeli takılmasını yürütmektedir bilgisayar programı ve bu modelin uyum kalitesi davranışlarda testleri olmak için geliştirilmiştir. çeşitleme modeli İzolasyon modeli olarak adlandırılır ve gen akış olmadan biridir. İki yakın akraba türlerin her Karşılaştırmalı DNA sekansı verileri, yöntem türlemesi yana zaman ve ata türün boyutunun tahmin edilmesini sağlar. izolasyon modeli aşağıdaki varsayar: - Veri örneklenmiş olan iki tür, ya da nüfus, geçmişte, bir tek ata türün, nüfusun, bir süre, T kuşak ortaya çıkmıştır. - ortak bir ata türün ya da nüfus sürekli etkili boyutu NA oldu. - iki soyundan türleri (populasyonları) sabit bir efektif boyutları sırasıyla N1 ve N2 sahiptir. - t nüfus ayırma şu hariç olmak üzere, popülasyon boyutları sabittir. - nüfus ayrılması için, türler (populasyonları) arasında sıfır gen akışı vardır. - Bütün mutasyonlar nötrdür. program dosyası otomatik olarak işletim sistemi tarafından aranan veri dosyası ile aynı klasörde veya bir klasörde ya bulunmalıdır. Program komut satırı parametreleri kullanarak çalıştırın veya basitçe programa ( 'wh') adını yazarak yapılabilir. komut satırı parametreleri kullanılmaz, program çalışma zamanı parametrelerin değerleri için sorar. Kullanıcı sadece programın adını veri dosyasının bulunduğu klasöre gidip yazarak programı başlatır (örneğin 'siteler') tuşuna girmek izledi. Program veri dosyası ve istenen analizi hakkında çeşitli sorular sorar. Neredeyse tüm komutlar ve seçenekler de komut satırı parametreleri kullanarak girilebilir. Program ile veya komut satırında talimatlar kullanılmadan başlatılabilir. Komut satırı talimatlar olmadan - basitçe istemi kısmındaki wh yazın. Program temel bilgileri isteyecektir. Bir PowerPC, program ikonuna tıklayarak komut satırı parametreleri girilebilir olduğu bir küçük pencere açar. Kullanıcı ayrıca sadece bu noktada getiriyi vurabilir ve program çalıştırma parametrelerini isteyecektir. Komut satırı parametreleri: Yazın ve girin wh -d'datafilename '-r'resultsfilename' -N'numsims' -L'ldtype '-A'ranseed' Neresi: 'Datafilename' programı ile aynı klasörde bir veri dosyasının adıdır 'Resultsfilename' sonuçlarını içerecek şekilde oluşturulacak dosyanın adıdır. sonuç dosyası '.wh' bir uzantısı ile oluşturulur 'Numsims' simülasyonlar sayısı çalıştırılacak olan bir tamsayıdır. Temel model oturtma simülasyonları gerektirmez. Bu değer sıfır veya boş değilse, veri dosyasının rekombinasyon oranları üzerinde gerekli bilgilere sahip olmalıdır. 'Ldtype' hesaplamak için bağlantı dengesizliği değer türünü programını söyler. Bu seçenek simülasyonları yapılabilir gerektirir ve veri dosyası rekombinasyon ve gözlenen LD değerlerine bilgiler içermesini. 'Ldtype' veri dosyası oluşturmak için kullanılan bağlantı dengesizliği ölçüsü ile aynı olmalıdır. 'Ldtype' Aşağıdaki değerler alabilir: 'R', korelasyon katsayısının çağırır 'S' başlatır ^ 2, korelasyon katsayısının kare r 'D', temel gametik dengesizlik ölçer D çağırır 'P' Dmax gözlenen alel frekansları verilen D olası maksimum değerdir D / Dmax eşittir D' çağırır. 'B', D mutlak değerini çağırır, | D | 'Ranseed' rasgele sayı tohum ve kullanıcı tam olarak simülasyonlar tekrar istemediği sürece, genel olarak gerekli değildir.
Wh İlgili Yazılım
