Yakınlaşmak amino asit dizisi seviyesindeki yakınsak ve paralel evrim
Şimdi İndirin

Yakınlaşmak Sıralama ve Özet

Yakınlaşmak Etiketler

sıra asit asit yazı tipi Asit işlemi amino asit bulmak amino asit bulucu amino asit ara Amino asit analizörü amino asit dizisi amino asit amino asit tercümanı asit teması amino asit özü asit çözeltisi amino asit kalıntısı optimal amino asit Nükleik asit dizisi amino asidi analiz etmek nükleik asit amino asit çiftini analiz et Amino Asitler Çifti Analizi amino asit dizisi analizi amino asit dizisini analiz eder amino asit sınıflandırması Amino Asit Topolojisi Yakınsak evrim Paralel evrim Yakınsak amino-asit dedektörü amino asidi saptamak Dizi Evrimi DNA Sırası Evrimi amino asit zincirini analiz et Asit işlemleri asit profesyonel asit pro 7

Yakınlaşmak Açıklama

Bu uygulama, amino asit dizisi seviyesindeki yakınsak ve paralel evrimi test etmek için geliştirilmiştir. Gözlemlenen yakınsak ve paralel ikamelerin rastgele bir şansa atfedilebileceği olasılıkları hesaplar. Bu paket bir program içeriyor: C dilinde yazılan Converg2.exe. Programı kullanmak için, amino asit dizilerini ve bu dizilerin ağaç topolojisini içeren bir giriş dosyasına ihtiyacınız vardır (bir örnek için LysozyMe.AA'ya bakınız). Bu dosya iki sayı ile başlar: sekans sayısı ve amino asit alanlarının sayısı (sıra uzunluğu). İkinci satır, ilk dizinin adı olacak ve üçüncü satır ilk sıra, vb. Sıralarda sadece 20 amino asit için tek harf kodu (büyük harf) izin verilir. Diziler hizalanmalı ve boşluklar veya diğer semboller zaten çıkarılmalıdır. Dosyanın son satırı, dizilerin ağaç topolojisidir. Ağaç formatı, Phylip Paketinde kullanılan ile aynıdır (Felsenstein 1995). Ağacın sınırlandırıldığını unutmayın, bu nedenle en derin dallanma düğümü için BITICION'tan ziyade hariste gerekir.

Yakınlaşmak İlgili Yazılım