jmotu

Barkod DNA Sırası veri analizi kolaylaştı.
Şimdi İndirin

jmotu Sıralama ve Özet

Reklamcılık

  • Rating:
  • Lisans:
  • Freeware
  • Yayıncı adı:
  • Mark Blaxter
  • İşletim sistemleri:
  • Windows All
  • Dosya boyutu:
  • 7.1 MB

jmotu Etiketler


jmotu Açıklama

JMOTU, barkod DNA dizisi verilerini moleküler operasyonel taksonomik birimlere (MOTU) kümelenmenize yardımcı olmak için özel olarak tasarlanmış kullanışlı, kullanımı kolay bir pakettir. Bir MOTU'nun ne olduğundan emin değilseniz, lütfen web sitemizdeki DNA barkodu sayfalarına bakın. JMOTU aşağıdakileri yapar: · Fastra veya Nexus formatındaki giriş dizilerini okur · Patlama ve İğneman-Wunch Kesin Küresel Hizalama Algoritması kombinasyonunu kullanarak dizinin çiftleri arasındaki mesafeleri hesaplar · Çeşitli kesme önlemlerini kullanarak kümeleri MOTU'ya giriş dizileri JMOTU, büyük veri kümelerini işleyebilir ve gerçekleştirilmesi gereken kesin küresel hizalamaların sayısını en aza indirmek için bir dizi filtreleme adımını kullanır. İkili mesafeleri hesaplarken, JMOTU boşlukları yoksayılır ve sadece nükleotit yanlış eşleşmeleri sayar, homopolimer çalıştırmasının neden olduğu sıralama hatalarına nispeten sağlam hale getirir. Kümeleme, giriş dizisi sırasına bağlı olmayan açgözlü bir algoritma kullanılarak gerçekleştirilir. JMOTU, yaklaşık 50.000 giriş dizisinin ham veri kümelerinde test edilmiştir ve onları küresel bir analiz için birleştirmeden önce veri alt kümelerinin ön plana çıkmasını önleyerek daha büyük veri kümelerini kümelenebilir.


jmotu İlgili Yazılım

Rdp

Fastra dosyalarını bu araçla görüntüleyin ve düzenleyin. ...

407 23.1 MB

İndirmek