| pknotsrg RNA katlama ve termodinamik eşleştirme yardımcı programı. |
Şimdi İndirin |
pknotsrg Sıralama ve Özet
- İşletim sistemleri:
- Windows All
pknotsrg Etiketler
pknotsrg Açıklama
PKSOTSRG, basit özyinelemeli psödoknotların sınıfı dahil olmak üzere RNA ikincil yapılarını katlamak için bir araçtır. Program O (n ^ 4) saatinde ve O (N ^ 2) boşluğunda çalışır, bu nedenle buradaki bibiserv üzerindeki uygulaması, 800 baza kadar uzunluk dizileri ile sınırlıdır. Hiçbir psödoknot içeren yapılar için enerji parametreleri, gerçek MFOLD 3.1 ile aynıdır. Katlanır sıcaklık 37C'ye sabitlenir. Şu anda, mevcut üç farklı mod var: PKSOTSRG-MFE: Minimum serbest enerjinin yapısını (düğümlü veya değil) yapısını hesaplar. PKSOTSRG-ENF: Bir Pseudoknot'u uygular: Bir yerde en az bir psödoknot içeren en enerjik olarak en iyi tam yapısını sunar. PKSOTSRG-LOC: "en iyi", nükleotit başına serbest enerji ile tanımlandığı herhangi bir yapısının elemanı olabilecek en iyi yerel psödoknotu sunar. S geri kalanı ortaya çıktı PknotsRG'yi alın ve aslında sizin için ne yapabileceğini görmek için bir dönüş için alın!
pknotsrg İlgili Yazılım